本发明提供了一种发根农杆菌介导的番木瓜毛状根遗传转化方法及番木瓜转基因阳植株，属于植物基因工程技术领域。本发明提供了一种不依赖组培的番木瓜遗传转化方法，可直接利用发根农杆菌处理外植体培养得到番木瓜转基因阳性植株，不用经过诱导愈伤组织、诱导分化生根等一系列繁琐复杂的无菌过程，避免了组织培养转化周期长、人力物力消耗大、阳性率较低等问题。本发明构建的发根农杆菌介导的遗传转化系统具有高效、稳定、快速的特点，利用固体TY培养基培养的发根农杆菌K599可直接侵染伤口，操作简单、毛根发生率及阳性率均较高，且无需额外的实验设备，适用于大部分实验室。