本发明涉及用药信息记录领域，具体涉及一种临床用药数据记录方法及系统。该方法首先获取每个患者不同维度的临床用药信息和患者的患病时间，并对临床用药信息进行量化，获得每个患者的各维度的用药信息编码值，根据各患者相同维度的用药信息编码值差异，获得每个患者的病症相似度，基于患者的病症相似度的差异，对患者进行聚类，并根据聚类簇中患者的病症相似度的差异和病症相似度的整体水平、患者的数量，以及患病时间的差异，获得患者记录优先度；根据所有患者相同维度的用药信息编码值的分布，获得维度记录优先度；结合患者记录优先度和维度记录优先度，对患者的临床用药信息进行记录。本发明能够提高对大量患者的临床用药数据记录的效率。