本发明提供了一种基于通用谱分解与多属性融合的海底扇刻画方法及系统，属于石油天然气勘探开发领域。包括：首先确定目标层位及海底扇发育顶、底界面，以顶、底界面为约束建立三维年代地层格架并对其内部地层进行三维自动追踪；然后对地震原始数据利用相关计算得到主频率数值，然后采用小波分频技术对主频率数值进行分频处理，得到一系列单频段分频数据体；利用三维自动追踪识别的地层对分频数据体提取敏感属性体的沿层地层切片，最后将结果融合显示刻画海底扇边界。本发明通过谱分解和多属性融合，提升了边界刻画的精度，同时在地层界面追踪时，采用自动追踪和人工干预相结合的方法，既减少了解释的工作量，又保证了界面追踪的准确性。