本申请公开了一种芯片版图编码器的训练方法、芯片版图的筛选方法及装置，属于集成电路技术领域。方法包括：获取样本芯片版图和初始编码器；对样本芯片版图进行几何变换，得到至少一个参考芯片版图；通过初始编码器提取样本芯片版图的版图特征和各个参考芯片版图的版图特征；基于样本芯片版图的版图特征和各个参考芯片版图的版图特征，对初始编码器进行训练，得到芯片版图编码器。针对几何变换前后的芯片版图，芯片版图编码器能够输出相近的版图特征，因此，芯片版图编码器侧重于提取能区分芯片版图类型的版图特征，有利于后续基于版图特征对芯片版图进行聚类时提高聚类结果的准确性。