技术领域
[0001] 本发明涉及一种应用于棒杆菌的启动子,尤其是一种棒杆菌中的与中心代谢相关的启动子PodhI及其应用,属于基因工程技术领域。
相关背景技术
[0002] 启动子位于转录起始点上游,是RNA聚合酶的识别和结合位点,由此启动转录。
[0003] 棒杆菌是安全生产菌,无内毒素及胞外水解酶活性,广泛应用于多种氨基酸及有机酸的生产,如谷氨酸,赖氨酸,鸟氨酸,精氨酸,尼龙-4等,其产品可作为饲料添加剂,食品添加剂,医药中间体,可降解塑料的前体,在化妆品行业也有着重要应用。
[0004] 近年来棒杆菌启动子工程取得了很大的进展,棒杆菌基因组上的启动子如Psod,Ptuf,PcspB等近年来被应用于增强相关基因的表达,并取得了一定的成效。虽然组成型启动子、诱导型启动子、合成启动子等都有所报道,但是真正应用于棒杆菌的还比较少,与中心代谢相关的启动子研究的也比较少,且迫切需求更多的启动子来增强基因的表达,平衡代谢流,以实现高产目的代谢产物的目标。
具体实施方式
[0011] 下面通过实例来证明PodhI启动子的应用,但并非局限于只能用作谷氨酸脱羧酶基因的启动子,还可应用于棒杆菌中任何基因及其相关代谢产物的合成。
[0012] 菌株:本发明所用到的菌株:高产谷氨酸的谷氨酸棒杆菌,大肠杆菌JM 109购自天根生物公司。
[0013] 试剂:限制性内切酶XbaI,T4DNA连接酶,PCR试剂均购自Thermo公司,基因组提取试剂盒,质粒抽提试剂盒,胶回收试剂盒,PCR产物纯化试剂盒,卡那霉素均购自上海生工,其他试剂均为国产或进口的分析纯试剂。
[0014] 种子培养基(100ml):葡萄糖2.5%,玉米浆3%,尿素0.8%,K2HPO4·3H2O 0.1%,MgSO4 0.02%,NaOH调pH 7.2。
[0015] 发酵培养基(100ml):葡萄糖10%,K2HPO4·3H2O 0.2%,玉米浆0.2%,MgSO40.04%,MnSO4·H2O 2mg/L,FeSO4·7H2O 2mg/L,NaOH调pH 7.2。
[0016] 启动子对gadB2的表达效果测定:(1)实时荧光定量PCR:实时荧光定量PCR主要用于检测gadB2的转录水平,取20h和40h发酵液,提取RNA,反转录合成cDNA,然后进行实时荧光定量PCR的测定;(2)谷氨酸脱羧酶(GAD)酶活检测:GAD酶活测定时,取40h发酵液,测定OD值,离心去上清,用pH7.2的磷酸缓冲液洗两次,去除发酵液及胞外粘附的杂质,再将细胞悬浮在含0.1%Triton的0.02M pH4.8的Na2HPO4-柠檬酸缓冲液中,获得全细胞液;GAD酶促反应体系为1ml,包括0.2M pH5.0Na2HPO4-柠檬酸缓冲液,30mM的谷氨酸钠,0.03mM的磷酸吡哆醛及400μl全细胞液,底物和全细胞提前于37℃预热10min,然后全细胞液加到反应体系中,于37℃反应1h,再煮沸10min结束反应,离心20min,上清用于检测合成的γ-氨基丁酸(GABA)含量;(3)高效液相色谱OPA柱前衍生法测定GABA产量:发酵液上清用终浓5%的TCA(三氯乙酸)稀释50倍,沉淀4h以上,12000rpm离心30min去除沉淀,取上清用于检测γ-氨基丁酸及谷氨酸的含量。
[0017] 实施例1:重组谷氨酸棒杆菌的构建及启动子PodhI强度检测
[0018] 1、以
[0019] 上游引物PodhI-F:
[0020] 5'-CATTTCTAGACGATCACGAGGGGGCACATT-3'
[0021] 下游引物PodhI-R:
[0022] 5'-CCCGGCTCTAGATCTTAACGATTTTCATCATA-3'扩增启动子片段PodhI(SEQ ID NO.1),将启动子与测试质粒pJYW-5-gadB2(pJYW-5构建方法见公开号CN103834679A、发明名称“一种不依赖抗生素为选择压力的棒状杆菌表达系统”的专利,pJYW-5在酶切位点XbaI及PstI之间连gadB2,gadB2见公开号CN102154345A、发明名称“谷氨酸脱羧酶基因及其应用”的专利)用XbaI酶切,载体需要去磷酸化,然后将启动子片段和载体用T4DNA连接酶连接过夜,转化到大肠杆菌感受态细胞JM109,挑选出正确的转化子,构建pJYW-5-PodhI-gadB2。
[0023] 2、将质粒pJYW-5-PodhI-gadB2电转进谷氨酸棒杆菌感受态细胞中,挑选出正确转化子,SH/pJYW-5-PodhI-gadB2
[0024] 3、将活化好的重组谷氨酸棒杆菌SH/pJYW-5-PodhI-gadB2接种到30ml种子培养基,30℃、200rpm,培养8h,转接到发酵培养基中,初始OD5621.9接到发酵培养基,10h-24h,通过补加尿素的方法维持发酵液pH在6.5-7.5,从24h开始,每12h取样测定OD、残糖、pH、GABA产量等各参数,直至72h发酵结束。
[0025] 发酵各参数测定结果表明,含PodhI菌株20h、40h的gadB2转录水平是含Psod菌株的20.04倍、2.69倍,是含Ptuf菌株的13.48倍、3.68倍;含PodhI菌株的谷氨酸脱羧酶活性是含Psod、Ptuf菌株的6.64倍、1.10倍;从72h GABA积累情况来看,含PodhI菌株比含Psod菌株提高了
1.79倍,比含Ptuf的菌株略低,综合三方面均证明启动子PodhI比对照启动子Psod强,与Ptuf强度相近。
[0026] 虽然本发明已以较佳实施例公开如上,但其并非用以限定本发明,任何熟悉此技术的人,在不脱离本发明的精神和范围内,都可做各种的改动与修饰,因此本发明的保护范围应该以权利要求书所界定的为准。