技术领域
[0001] 本实用新型属于生物技术领域,尤其涉及鸡RNA m6A甲基转移酶3(METTL3)和甲基转移酶14(METTL14)基因表达检测试剂盒,主要用于鸡生长发育和疾病等方面的研究。
相关背景技术
[0002] RNA m6A修饰是指RNA腺嘌呤(A)的N6位引入甲基的过程。研究表明,RNA m6A 修饰是高等真核生物体内最常见的转录后修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化,通过调控6
RNA稳定、定位、运输、剪接和翻译来发挥重要的生物学功能。甲基转移酶是RNA mA 生物学
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过程的一种关键调控蛋白,催化RNA上的腺嘌呤发生m A。甲基转移酶以复合物存在形式发
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挥生物学作用,包括mA‑METTL复合体和mA‑METTL关联复合体。mA‑METTL 复合体包括甲基转移酶3(METTL3)与甲基转移酶14(METTL14),它们可以形成稳定的异二聚体,前者作为催
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化亚基是第一个被发现的甲基转移酶,后者可以促进与RNA的结合,它们是RNA m A修饰所必需的。
[0003] 近年来,越来越多的研究表明,RNA m6A修饰在基因表达调控、动物发育和人类疾6
病中起着重要作用,而目前在鸡上有关RNA mA修饰研究的报道还比较少。因此开发参与鸡
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RNA mA修饰生物学过程的重要基因定量检测试剂盒,用于鸡生长发育和疾病等方面的研究,对家禽生产等实际应用方面将提供帮助。
实用新型内容
[0004] 本实用新型的目的是提供一种RNA m6A甲基转移酶定量检测试剂盒,本实用新型试剂盒准确性高、快速、价格低廉,通过实时荧光定量RT‑PCR技术检测鸡METTL3基因和METTL14 基因在组织和细胞中的表达量。
[0005] 本实用新型的目的是通过以下技术方案实现的,RNA m6A甲基转移酶定量检测试剂盒,包括盒体和盖体,其特征是,所述盒体内设有SYBR Green Master热启动荧光PCR混合物、鸡METTL3基因正反向引物、鸡METTL14基因特异性正反向引物、鸡内参基因GAPDH正反向引物、ROX染料、灭菌DEPC水。
[0006] 优选的,所述鸡METTL3基因正反向引物序列为:
[0007] F:5’‑GCCATCGATACGCCCGAAAC‑3’;
[0008] R:5’‑TAGGTGACGATGGTGGGACC‑3’。
[0009] 优选的,所述鸡METTL14基因正反向引物序列为:
[0010] F:5’‑CTGGATCTTGGCCGAGTGTG‑3’;
[0011] R:5’‑AGGCAGTGCTCCTTGGTTCT‑3’。
[0012] 优选的,所述鸡内参基因GAPDH正反向引物序列为:
[0013] F:5’‑CGATCTGAACTACATGGTTTAC‑3’;
[0014] R:5’‑TCTGCCCATTTGATGTTGC‑3’。
[0015] 优选的,所述盒体与盖体之间通过活动件相连接,
[0016] 盖体侧壁上设有锁紧孔;盒体侧壁上设有容纳腔,容纳腔内设置弹性件,弹性件自由端设置安装板,安装板上设有锁紧块,锁紧块伸入锁紧孔内并在弹性件的作用下,实现盖体与盒体的锁紧。
[0017] 优选的,所述安装板下部设有按压部;按压部位于锁紧的盒体侧壁下方。
[0018] 优选的,所述按压部、盒体侧壁相对端面上对应设有相配合的导向块、导向槽。
[0019] 优选的,所述盒体内设有衬垫,衬垫上设有试剂容纳腔。
[0020] 与现有技术相比,本实用新型具有以下有益效果:
[0021] 第一,通过本实用新型试剂盒可得到METTL3基因和METTL14基因在胸大肌和前背阔肌中的相对表达量:以慢肌纤维为主的前背阔肌中METTL3基因和METTL14基因的表达量均显著高于以快白肌纤维为主的胸大肌(P<0.05)。提示,METTL3基因和METTL14基因的表达与肌纤维类型密切相关。
[0022] 第二,本实用新型对盒体和盖体的锁紧结构进行改进,通过可移动的锁定块与锁定孔的配合,实现盖体的锁紧与开启;锁定块在弹性件的作用下,向前顶出,伸入锁定孔内,实现锁紧;按压弹性件内缩,带动锁紧块后移,即可开启盖体。
[0023] 第三,本实用新型在安装板上设置按压部,方便对弹性件施力,且按压部隐藏在盒体侧壁下方,外端面不突出于盒体侧壁外侧面。
[0024] 第四,本实用新型在按压部、盒体侧壁相对端面上对应设有相配合的导向块、导向槽,保证盖体运动的一致性。
具体实施方式
[0031] 如图1‑5所示,一种RNA m6A甲基转移酶定量检测试剂盒,包括盒体1、盖体2,盒体 1与盖体2之间通过活动件19相连接。活动件19可以为铰连,也可以为弹性塑料件。
[0032] 盒体1内设有衬垫3,衬垫3上设有若干个试剂容纳腔4,试剂容纳腔4中分别设置SYBR Green Master热启动荧光PCR混合物5、鸡METTL3基因特异性正反向引物6、鸡METTL14 基因特异性正反向引物7、鸡内参基因GAPDH特异性正反向引物8、ROX染料9、灭菌DEPC 水10。
[0033] 其中,鸡METTL3基因正反向引物6序列为:
[0034] F:5’‑GCCATCGATACGCCCGAAAC‑3’,
[0035] R:5’‑TAGGTGACGATGGTGGGACC‑3’;
[0036] 鸡METTL14基因正反向引物7序列为:
[0037] F:5’‑CTGGATCTTGGCCGAGTGTG‑3’,
[0038] R:5’‑AGGCAGTGCTCCTTGGTTCT‑3’;
[0039] 以及鸡内参基因GAPDH正反向引物8序列为:
[0040] F:5’‑CGATCTGAACTACATGGTTTAC‑3’,
[0041] R:5’‑TCTGCCCATTTGATGTTGC‑3’。
[0042] 盖体侧壁上设有锁紧孔17;盒体侧壁上设有容纳腔11,容纳腔11内设置弹性件12,弹性件12自由端设置安装板13,安装板13上设有锁紧块14,锁紧块14伸入锁紧孔17内并在弹性件12的作用下,实现盖体2与盒体1的锁紧。
[0043] 本实用新型对盒体和盖体的锁紧结构进行改进,通过可移动的锁定块与锁定孔的配合,实现盖体的锁紧与开启;锁定块在弹性件的作用下,向前顶出,伸入锁定孔内,实现锁紧;按压弹性件内缩,带动锁紧块后移,即可开启盖体。
[0044] 安装板13下部设有按压部15;按压部15位于锁紧的盒体侧壁下方。本实用新型在安装板上设置按压部,方便对弹性件施力,且按压部隐藏在盒体侧壁下方,外端面不突出于盒体侧壁外侧面。
[0045] 按压部15、盒体侧壁相对端面上对应设有相配合的导向块16、导向槽18,保证盖体运动的一致性。
[0046] 上述RNA m6A甲基转移酶定量检测试剂盒的使用方法如下:
[0047] (1)组织或细胞RNA的抽提与纯化:从鸡组织或细胞中提取总RNA并纯化;
[0048] (2)cDNA第一链的合成:以步骤(1)中所提取的RNA为模板,反转录合成cDNA第一链;
[0049] (3)荧光定量real time PCR扩增反应:采用SYBR Green染料法,以上述(2)合成的 cDNA第一链为模板,用提供的鸡METTL3基因特异性正反向引物6、鸡METTL14基因特异性正反向引物7、鸡内参基因GAPDH特异性正反向引物8,在荧光定量PCR仪上进行real time PCR扩增;
[0050] 本实用新型所述步骤(3)中real time PCR扩增的反应条件设置如下:
[0051] 95℃预变性10min;然后40个循环的95℃变性30s,退火56℃30s;最后95℃1min, 60℃30s,95℃30s。
[0052] 鸡组织或细胞样本经反转录成cDNA第一链后,对鸡METTL3基因、鸡METTL14基因和鸡内参基因GAPDH按照设定好的条件同时进行real time PCR反应,每个样品均做3个平行管,每次反应均设无模板对照(NTC)。以GAPDH基因为内参对照,对鸡METTL3基因和METTL14‑ΔΔCT基因mRNA表达水平进行校正,并采用2 法对数据进行处理,计算鸡 METTL3基因和METTL14基因mRNA相对表达量。
[0053] 实施例:鸡胸大肌和前背阔肌中METTL3基因和METTL14基因表达检测[0054] 采集成年文昌鸡胸大肌和前背阔肌样品,置于液氮速冻后转入‑80℃冰箱保存,采用Trizol 裂解法,从采集到的肌肉样本中提取总RNA,以提取的总RNA为模板,按照RT‑PCR试剂盒(Takara,Dalian,China)说明书反转录合成cDNA第一链。
[0055] 荧光定量real time PCR扩增反应:采用SYBR Green I染料法,以上述合成的cDNA第一链为模板,设计的鸡METTL3基因和METTL14基因特异性正反向引物和鸡内参基因 GAPDH的特异性正反向引物,在Max3000P荧光定量PCR仪(爱普拜斯)上进行。即鸡肌肉样本总RNA反转录成cDNA第一链后,分别配置鸡METTL3基因、METTL14基因和内参基因GAPDH进行real‑time PCR扩增所需的反应体系,每个样品均做3个平行管,每次反应均设无模板对照(NTC)。
[0056] 荧光定量PCR扩增体系配制见表1。
[0057] 表1荧光定量PCR扩增体系
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[0060] 将每个样本的3个基因的扩增体系同时放入荧光定量PCR仪,进行PCR反应,real time PCR扩增的反应条件设置如下:
[0061] 95℃预变性10min;然后40个循环的95℃变性30s,退火56℃30s;最后95℃1min, 60℃30s,95℃30s。
[0062] 每个样品均做3个平行管,每次反应均设无模板对照(NTC)。以GAPDH基因为内参对‑ΔΔCt照,对鸡METTL3基因和METTL14基因mRNA表达水平进行校正,并采用2 法对数据进行处理,其中ΔCt=(Ct目的基因‑Ct内参基因),以胸大肌为对照组,计算METTL3基因和METTL14基因在胸大肌和前背阔肌中的相对表达量。
[0063] 胸大肌和前背阔肌中METTL3基因和METTL14基因的表达结果见图6。由图6可以看出,以慢肌纤维为主的前背阔肌中METTL3基因和METTL14基因的表达量均显著高于以快白肌纤维为主的胸大肌(P<0.05)。提示,METTL3基因和METTL14基因的表达与肌纤维类型密切相关。