本发明一种入射光和出射光光学适配器联动控制系统，包括：显示设备，设置有入射光选择模块和出射光输出选择模块；入射光选择模块用于接收选择的入射光光源；所述出射光输出选择模块用于接收选择的待导入的光学组件；控制设备，接收显示设备发送的信号，基于选择的入射光光源及待导入的光学组件，发射不同的控制信号至入射光光学适配器及出射光光学适配器；入射光光学适配器，接收控制设备发送的控制信号，控制选择的入射光光源入射，并将对应的入射光光源传导至样品；出射光光学适配器，接收控制设备发送的控制信号，控制采集的样品的出射信号进入，并将出射信号传导至待导入的光学组件。本发明使操作简便，快捷精准对光学适配器进行联动调节。