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用于制备螺环低聚物的方法和化合物实质审查 发明

技术领域

[0005] 本公开涉及用于制备螺环低聚物的方法和化合物。

相关背景技术

[0006] 双肽,也称为螺环低聚物,是由氨基酸形成的梯形低聚物或聚合物。螺环低聚物可用作治疗剂、催化剂、传感器、抗体模拟物和纳米技术。它们的形状可以基于单体的立体化学和序列进行定制。在合成双肽时,使用氨基酸形成二酮哌嗪环以产生螺环低聚物。
[0007] 用于合成螺环低聚物的标准做法为经由通过在合成的各阶段依次添加单个双氨基酸的分步法。虽然这种类型的方法允许立体化学控制,但是它们是相对低效率的。例如,此类方法通常产生不超过几毫克的螺环低聚物,步骤难以进行,并且所述方法经常需要长
时间和大量的劳动。
[0008] 因此,本领域需要经由简单的步骤和/或以高收率制备螺环低聚物的有效方法。本发明解决了本领域中这一尚未满足的需求。

具体实施方式

[0054] 本发明提供用于制备螺环低聚物的高效方法。与本领域中的方法相反,本文中所述的方法允许制备更大量的具有高度预组织结构(preorganized structure)的螺环低聚
物。通过这样做,可以组装多种多样的不同长度序列的砌块以产生几乎无限数量的具有可
设计的形状和官能团显示的高度预组织的分子。
[0055] 本发明使用提供以高收率制备螺环低聚物及其中间体的能力的关键且独特的步骤。最初,该方法允许以40‑50克的批量制备中间体,这远超过本领域中记载的产量。在对该方法进行改进之后,可以制备多公斤批量的中间体和产物。
[0056] 在特征之中,一个独特的步骤包括使用精巧的Fmoc基团在分子的关键位置处保护胺。迄今为止,在用于制备螺环低聚物的方法中已使用了各种各样的保护基团。然而,本发明人发现,简单地将传统的保护基团更换为Fmoc基团不是高效的并且大大降低螺环低聚物
的收率,而螺环低聚物的收率已经很低了。也可以使用大范围和数量的官能团经由简单的
步骤来容易地将Fmoc保护基团官能化。另一关键步骤包括使用例如铜等金属选择性地络合
氨基酸基团,从而允许用Fmoc基团选择性保护其它胺。这些关键步骤得到高的收率(即,>
90%)和大于95%的纯度。
[0057] 最后,一旦形成螺环低聚物,可以使用非严格条件在最短时间内将其顺利地刚性化。
[0058] 定义
[0059] 在本发明中,除非上下文另有明确说明,否则单数形式“一种/一个(a)”、“一种/一个(an)”和“该/所述(the)”包括复数指代,并且提及特定数值至少包括该特定值。因此,例如,提及“材料”为提及此类材料以及本领域技术人员已知的其等同物中的至少一种等。
[0060] 当通过使用描述词“约”将值表示为近似值时,将理解的是,特定值形成另一实施方案。通常,使用术语“约”表示近似值,其可以取决于所公开的主题试图获得的期望特性而变化并且应基于其功能在其使用的特定上下文中解释。在本发明的一些方面,“约”是指为所述值的±10%的值的范围。例如,“约10”是指“9至11”以及“10”。本领域技术人员将能够按照常规对其进行解释。在一些情况下,用于特定值的有效数字的数量可以为确定词语“约”的范围的一种非限制性方法。在其它情况下,一系列值中使用的等级可以用于确定针对各值的术语“约”可用的预期范围。在存在的情况下,所有范围均为包含的且可组合的。
即,提及范围中所述的值包括该范围内的每个值。应当理解,在提供参数范围的情况下,本发明还提供该范围内的所有整数及其十分位数。例如,“20‑40mg”包括20.0mg、20.1mg、
20.2mg、20.3mg等,直至40.0mg。
[0061] 当示出列表时,除非另有说明,否则应当理解该列表的各单独的要素和该列表的每个组合应当解释为分开的实施方案。例如,示出为“A、B或C”的实施方案的列表应当解释为包括实施方案“A”、“B”、“C”、“A或B”、“A或C”、“B或C”或“A、B或C”。
[0062] 应当理解,为清楚起见在本文中在分开的实施方案的上下文中描述的本发明的某些特征也可以在单个实施方案中组合提供。即,除非明显不相容或被排除,否则将各单独的实施方案视为可与任何其它实施方案组合并且认为此类组合为另一实施方案。相反,为简
洁起见在单个实施方案的上下文中描述的本发明的各种特征也可以分开提供或以任何子
组合提供。应当进一步注意,可以将权利要求撰写为排除任何任选的要素。因此,该声明旨在用作与权利要求要素的叙述一起使用例如“仅仅(solely)”和“仅(only)”等排他性术语或使用“否定性”限定的先决基础。最后,虽然可以将实施方案描述为一系列步骤的一部分或者更一般的结构的一部分,但是各所述步骤自身也可以被认为是独立的实施方案。
[0063] 如本文中所使用的术语“卤素”是指Cl、F、Br或I。在一些方面,卤素为Cl。在其它方面,卤素为F。在进一步的方面,卤素为Br。在又一些其它方面中,卤素为I。
[0064] 如本文中所使用的“C0”是指不存在碳原子。例如,C0‑6烷基OH是指‑OH和C1‑6烷基。
[0065] 如本文中所使用的术语“烷基”是指包含1至12个碳原子的脂肪族烃,即,C1‑12烷基。在一些实施方案中,烷基为甲基、乙基、丙基、丁基、戊基、己基、庚基、辛基、壬基、癸基等。在其它实施方案中,烷基为C1‑8烷基。在进一步的实施方案中,烷基为C1‑6烷基。在更进一步的实施方案中,烷基为C1‑4烷基。在又一些其它实施方案中,烷基为C1‑4烷基。烷基的实例包括甲基、乙基、丙基(例如,正丙基、异丙基)、丁基(例如,仲丁基、叔丁基、异丁基)、3‑戊基、己基、庚基、辛基、壬基、和癸基。如本文中所述,烷基可以是未取代的或取代的,即,任选取代的。在某些方面,烷基被两个取代基取代。在进一步的方面,烷基被一个取代基取代。在其它方面,烷基被三个取代基取代。在更进一步的方面,烷基未被取代。
[0066] 如本文中所使用的术语“烯基”是指包含一个或多个碳‑碳双键的烷基。在一些实施方案中,烯基包含一个、两个或三个碳‑碳双键。在其它实施方案中,烯基包含一个碳‑碳双键。在进一步的实施方案中,烯基为C2‑6烯基。在又一些其它实施方案中,烯基为C2‑4烯基。在更进一步的实施方案中,烯基为C3‑4烯基。非限制性示例性烯基包括乙烯基、丙烯基、异丙烯基、丁烯基、仲丁烯基、戊烯基、己烯基和‑CH=C(CH3)2。烯基可以是未取代的或取代的。在一些实施方案中,烯基被两个取代基取代。在进一步的实施方案中,烯基被一个取代基取
代。在又一些其它实施方案中,烯基被三个取代基取代。在更进一步的实施方案中,烯基未被取代。
[0067] 如本文中所使用的术语“炔基”是指包含一个或多个碳‑碳三键的烷基。在一些实施方案中,炔基包含一个、两个或三个碳‑碳三键。在其它实施方案中,炔基包含一个碳‑碳三键。在进一步的实施方案中,炔基为C2‑6炔基。在又一些其它实施方案中,炔基为C2‑4炔基。在更进一步的实施方案中,炔基为C3‑4炔基。其中,非限制性示例性炔基包括乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基等。炔基可以是未取代的或取代的。在一些实施方案中,炔基被两个取代基取代。在进一步的实施方案中,炔基被一个取代基取代。在又一些其它实施方案中,炔基被三个取代基取代。在更进一步的实施方案中,炔基未被取代。
[0068] 如本文中所使用的术语“烷氧基”是指在基团内包含氧原子的如本文中所定义的任选取代的烷基。在一些实施方案中,烷氧基为连接至末端氧原子的烷基。在其它实施方案中,烷氧基为C1‑6烷氧基。在进一步的实施方案中,烷氧基为C1‑4烷氧基。烷氧基的实例包括n i
甲氧基(OCH3)、乙氧基(OCH2CH3或CH2OCH3)、丙氧基(例如,‑OPr、‑OPr)、或丁氧基(例如,‑n i s t
OBu、‑O Bu、‑OBu、‑O Bu)。烷氧基可以是未取代的或取代的。在一些实施方案中,烷氧基被两个取代基取代。在进一步的实施方案中,烷氧基被一个取代基取代。在又一些其它实施方案中,烷氧基被三个取代基取代。在更进一步的实施方案中,烷氧基未被取代。
[0069] 如本文中所使用的术语“环烷基”是指包含1至3个环和3至12个碳原子的饱和或部分不饱和的环状脂肪族烃,即,C3‑12环烷基或C3‑12环烯基。在一些实施方案中,环烷基具有两个环。在其它实施方案中,环烷基具有一个环。在进一步的实施方案中,环烷基是饱和的。在又一些其它实施方案中,环烷基具有一个或两个双键。在更进一步的实施方案中,环烷基为C3‑8环烷基。在又进一步的实施方案中,环烷基为C3‑7环烷基。在另外的其它实施方案中,环烷基为C3‑7环烯基。在其它实施方案中,环烷基为C3‑6环烷基。在进一步的实施方案中,环烷基为C3‑6环烷基。其中,环烷基的实例包括环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、环辛基、降冰片基、十氢化萘、金刚烷基、环己烯基和环戊烯基等。环烷基可以是未取代的或取代的。
在一些实施方案中,环烷基被两个取代基取代。在进一步的实施方案中,环烷基被一个取代基取代。在又一些其它实施方案中,环烷基被三个取代基取代。在更进一步的实施方案中,环烷基未被取代。
[0070] 如本文中所使用的术语“氰基烷基”是指被一个或多个CN取代的所述烷基。在一些实施方案中,氰基烷基包含一个CN取代基。在其它实施方案中,氰基烷基包含两个CN取代基。C1‑6氰基烷基的实例包括CH2CN、CH2CH2CN、CHCNCH3而没有限制。
[0071] 如本文中所使用的术语“卤代烷基”是指被一个或多个卤素取代的所述烷基。在一些实施方案中,卤代烷基包含一个或多个F,即,氟烷基。在其它实施方案中,卤代烷基包含一个卤素(例如,F)。在进一步的实施方案中,卤代烷基包含两个卤素(例如,F)。在又一些其它实施方案中,卤代烷基包含三个卤素(例如,F)。其中,C1‑6卤代烷基的实例包括CH2F、CHF2、CF3、CH2CFH2、CH2CF2H、CH2CH2CF3而没有限制。
[0072] 如本文中所使用的术语“卤代烷氧基”是指被一个或多个卤素取代的所述烷氧基。在一些实施方案中,卤代烷氧基包含一个或多个F,即,氟烷基。在其它实施方案中,卤代烷氧基包含一个卤素(例如,F)。在进一步的实施方案中,卤代烷氧基包含两个卤素(例如,F)。
在又一些其它实施方案中,卤代烷氧基包含三个卤素(例如,F)。其中,C1‑6卤代烷氧基的实例包括OCH2F、OCHF2、OCF3、OCH2CFH2、OCH2CF2H、OCH2CH2CF3而没有限制。
[0073] 如本文中所使用的术语“芳基”是指具有5‑14个碳原子的单环或双环不饱和环系,即,C5‑14芳基。在一些实施方案中,芳基具有6‑12个碳原子,即,C6‑12芳基。在进一步的实施方案中,芳基具有6‑10个碳原子,即,C6‑10芳基。在其它实施方案中,芳基具有6‑8个碳原子,即,C6‑8芳基。芳基的实例包括苯基、萘基(1‑萘基、2‑萘基)、菲基、蒽基、茚基、薁基、联苯基、联苯基烯基和芴基而没有限制。在一些实施方案中,芳基为苯基或萘基。术语“芳基”还包括与环烷基稠合的苯基。芳基可以是未取代的或取代的。在一些实施方案中,芳基为任选取代的苯基。
[0074] 如本文中所使用的术语“杂芳基”是指具有5至14个环原子的单环或双环芳香族环系,即,5‑14元杂芳基。杂芳基包含碳原子和一个或多个杂原子,所述杂原子为氧、氮和硫。
在一些实施方案中,杂芳基包含1、2、3或4个氧、氮和/或硫。在其它实施方案中,杂芳基包含三个杂原子。在进一步的实施方案中,杂芳基包含两个杂原子。在又一些其它实施方案中,杂芳基包含一个杂原子。在又一些其它实施方案中,杂芳基为5‑10元杂芳基。在更进一步的实施方案中,杂芳基为5或6元杂芳基。在其它实施方案中,杂芳基是5元的。在进一步的实施方案中,杂芳基为6元的。杂芳基的实例包括噻吩基(例如,噻吩‑2‑基、噻吩‑3‑基)、苯并[b]噻吩基、萘并[2,3‑b]噻吩基、噻蒽基、呋喃基(例如,2‑呋喃基、3‑呋喃基、4‑呋喃基)、苯并呋喃基、吡喃基、噻吩基、苯并呋喃基、异苯并呋喃基、苯并噁唑基、色烯基(chromenyl)、呫吨基、吡咯基(例如,吡咯‑2‑基、吡咯‑3‑基)、咪唑基(例如,咪唑‑2‑基、咪唑‑4‑基、1‑甲基咪唑基)、吡唑基(例如,吡唑‑3‑基、吡唑‑4‑基、吡唑‑5‑基)、吡啶基(例如,吡啶‑1‑基、吡啶‑2‑基、吡啶‑3‑基、吡啶‑4‑基)、吡嗪基(例如,吡嗪‑2‑基、吡嗪‑3‑基、吡嗪‑5‑基、吡嗪‑
6‑基)、嘧啶基(例如,嘧啶‑2‑基、嘧啶‑4‑基、嘧啶‑5‑基)、哒嗪基、异吲哚基、3H‑吲哚基、吲哚基、吲唑基、嘌呤基、异喹啉基、喹啉基、酞嗪基、萘啶基(例如,1,8‑萘啶基)、噌啉基、三唑基(例如,1,2,4‑三唑‑1‑基、1,2,4‑三唑‑3‑基、1,2,4‑三唑‑5‑基)、噻二唑基(例如,1,2,3‑噻二唑基、1,2,4‑噻二唑基、1,2,5‑噻二唑基、1,3,4‑噻二唑基)、噁二唑基(例如,1,2,3‑噁二唑基、1,2,4‑噁二唑基、1,2,5‑噁二唑基、1,3,4‑噁二唑基)、喹唑啉基、蝶啶基、4H‑咔唑基、咔唑基、β‑咔啉基、菲啶基、吖啶基、菲咯啉基、吩嗪基、噻唑基(例如,噻唑‑2‑基、噻唑‑
4‑基、噻唑‑5‑基、2‑甲基噻唑基)、异噻唑基(例如,异噻唑‑3‑基、异噻唑‑4‑基、异噻唑‑5‑基)、酚噻唑基、异噁唑基(例如,异噁唑‑3‑基、异噁唑‑4‑基、异噁唑‑5‑基、3,5‑二甲基异噁唑基)、呋呫基(furazanyl)、吡唑并[1,5‑a]吡啶基、苯并异噻唑基、咪唑并[1,5‑a]吡啶基(例如,咪唑并[1,5‑a]吡啶‑1‑基)、吡咯并[1,2]哒嗪基(例如,吡咯并[1,2]哒嗪‑5‑基、吡咯并[1,2]哒嗪‑6‑基)、苯并[d]噻唑基(例如,苯并[d]噻唑‑3‑基、苯并[d]噻唑‑2‑基)、苯并[d]咪唑基(例如,苯并[d]咪唑‑2‑基)、苯并[d]噁唑基(例如,苯并[d]噁唑‑2‑基)、苯并[c]异噁唑基(例如,苯并[c]异噁唑‑3‑基)、异噻唑基、4,5,6,7‑四氢吡唑并[1,5‑a]吡啶基、吩噁嗪基、三嗪基、吲哚嗪基、喹啉基、1,2,3,4‑四氢喹啉基、异喹啉基、1,2,3,4‑四氢异喹啉基、苯并[b]噻吩基、1H‑吲唑基(例如,吲唑‑3‑基)、苯并噻唑基、4H‑喹嗪基、喹喔啉基、吩噻嗪基、噁唑基(例如,噁唑‑2‑基、噁唑‑4‑基、噁唑‑5‑基)、或2‑芘基。术语“杂芳基”还包括N‑氧化物。杂芳基可以是未取代的或取代的。在一些实施方案中,杂芳基被两个取代基取代。在进一步的实施方案中,杂芳基被一个取代基取代。在又一些其它实施方案中,杂芳基被三个取代基取代。在更进一步的实施方案中,杂芳基未被取代。取代可以发生在任何可用的碳或杂原子(例如,氮)或二者上,只要取代基化合价允许即可。杂芳基还包括具有稠合的任选取代的环烷基或稠合的任选取代的杂环基的杂芳基。
[0075] 如本文中所使用的术语“杂环基”是指包含一个、两个或三个具有3‑14个环成员的环的非芳香族的饱和或部分不饱和的基团,即,3‑14元杂环基。杂环基包含碳原子和一个或多个氧原子、硫原子和/或氮原子,其可以被氧化或季铵化。在一些实施方案中,环CH2‑被‑C(=O)‑取代。术语“杂环基”还包括具有稠合的任选取代的芳基的基团,例如,吲哚啉基或色满‑4‑基。在一些实施方案中,杂环基为C4‑6杂环基。杂环基可以任选地通过任何可用的碳或杂原子连接至分子的其余部分。杂环基的实例包括氮杂环丁烷基(例如,氮杂环丁烷‑1‑基、氮杂环丁烷‑2‑基、氮杂环丁烷‑3‑基)、二噁烷基、四氢吡喃基、吡咯烷基、哌啶基、吗啉基、哌嗪基、吡咯烷基、吲哚啉基、氧杂环丁烷基、四氢呋喃基、四氢噻吩基、2‑吡唑啉基、吡唑烷基、三噻烷基、吲哚嗪基、苯并[b]噻吩基、1H‑吲唑基、苯并噻唑基、4H‑喹嗪基、喹啉基、1,2,3,4‑四氢喹啉基、异喹啉基、1,2,3,4‑四氢异喹啉基、喹喔啉基、吩噻嗪基。杂环基可以是未取代的或取代的。在一些实施方案中,杂环基被两个取代基取代。在进一步的实施方案中,杂环基被一个取代基取代。在又一些其它实施方案中,杂环基被三个取代基取代。在更进一步的实施方案中,杂环基未被取代。
[0076] 以上或本文中所述的任何基团/取代基可以被以下基团中的一个或多个取代:CN、卤素、NO2、OH、NH2、C1‑6烷氧基、C1‑6烷基、C2‑6烯基、C2‑6炔基、NH(C1‑6烷基)、N(C1‑6烷基)(C1‑6烷基)、芳基、O‑芳基、C1‑6烷基SH、‑C(O)C1‑6烷基、‑C(O)OC1‑6烷基、‑C(O)芳基、‑C(O)O芳基、‑C(O)杂芳基、‑C(O)O杂芳基、‑C(O)杂环基、‑C(O)O杂环基、C1‑6氰基烷基、C3‑8环烷基、C1‑6卤代烷氧基、C1‑6卤代烷基、杂芳基、杂环基、‑C1‑6烷基(杂环基)、‑C1‑6烷基(芳基)、‑C1‑6烷基(杂芳基)、‑C1‑6烷基(环烷基)、C1‑6羟基烷基、C(O)NH2、或OC(O)NH2。
[0077] 如本文中所使用的术语“核碱基”是指任选取代的腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶。在一些实施方案中,核碱基为嘌呤碱基例如腺嘌呤或鸟嘌呤。在其它实施方案中,核碱基为嘧啶碱基例如胞嘧啶、尿嘧啶或胸腺嘧啶。在进一步的实施方案中,核碱基为修饰的核碱基例如修饰的嘌呤核碱基或修饰的嘧啶核碱基。修饰的核碱基的实例包括次黄嘌呤、黄嘌呤、7‑甲基鸟嘌呤、肌苷、黄苷、7‑甲基鸟苷、5,6‑二氢尿嘧啶、5‑甲基胞嘧啶、5‑羟基甲基胞嘧啶、二氢尿苷或5‑甲基胞苷。在又一些其它实施方案中,核碱基为人工核碱基例如异鸟嘌呤、异胞嘧啶、2‑氨基‑6‑(2‑噻吩基)嘌呤或吡咯‑2‑甲醛。
[0078] 如本文中所使用的术语“氨基酸”是指天然氨基酸或非天然氨基酸。在一些实施方案中,氨基酸为天然氨基酸。在某些方面,氨基酸为精氨酸(Arg)、组氨酸(His)、赖氨酸(Lys)、天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu)、丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、天冬酰胺(Asn)、谷氨酰胺(Gln)、半胱氨酸(Cys)、硒代半胱氨酸(Sec)、甘氨酸(Gly)、脯氨酸(Pro)、丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)、异亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)、甲硫氨酸(Met)、苯丙氨酸(Phe)、酪氨酸
(Tyr)、色氨酸(Trp)、或吡咯赖氨酸。在进一步的实施方案中,氨基酸为非天然氨基酸。在某些实施方案中,氨基酸为4‑氨基苯甲酸(PABA)、别异亮氨酸、别苏氨酸、羧基谷氨酸、胱硫醚、D‑丙氨酸、脱氢丙氨酸、D‑谷氨酸、二氨基庚二酸、黎豆氨酸、甘氨酸甜菜碱同型半胱氨酸、同型正亮氨酸、同型丝氨酸、羟基甘氨酸、羟基脯氨酸、羟腐胺赖氨酸(hypusine)、异丝氨酸、异缬氨酸、羊毛硫氨酸、N‑乙基丙氨酸、N‑乙基甘氨酸、N‑乙基β‑丙氨酸、N‑异丙基甘氨酸、N‑甲基丙氨酸、N‑甲基β‑丙氨酸、正亮氨酸、正缬氨酸、N‑丙基甘氨酸、O‑甲基‑同型丝氨酸、鸟氨酸、哌啶酸、焦谷氨酸、肌氨酸、硒代半胱氨酸、硒代同型半胱氨酸、硒代甲硫氨酸、硒代乙硫氨酸、牛磺酸、叔亮氨酸、α,β‑二氨基丙酸、α,γ‑二氨基丁酸、α‑氨基异丁酸、α‑氨基‑正丁酸、α‑氨基‑正庚酸、α‑羟基‑γ‑氨基丁酸、β‑丙氨酸、β‑氨基异丁酸、β‑氨基‑正丁酸、γ‑氨基丁酸、δ‑氨基乙酰丙酸、1‑氨基环丙烷‑1‑羧酸、氮杂环丁烷‑2‑羧酸、环亮氨酸、或伪脯氨酸。在一些实施方案中,用如本文中所述的合适的保护基团保护氨基酸。
[0079] 如本文中所使用的术语“糖”是指如本领域中已知的简单糖或复合糖。在一些实施方案中,糖为单糖例如葡萄糖、果糖或半乳糖。在其它实施方案中,糖为二糖或双糖(两个单糖通过糖苷键连接)例如蔗糖、乳糖或麦芽糖。在一些实施方案中,用本文中合适的保护基团保护糖。
[0080] 范围:贯穿本发明,本发明的各种方面可以范围形式呈现。应当理解,范围形式的描述仅仅是为了方便和简洁,并且不应当解释为对本发明范围的不可改变的限制。因此,应当认为范围的描述具体地公开了所有可能的子范围以及该范围内的单个数值。例如,应当认为范围的描述(例如1~6)具体地公开了子范围,例如1~3、1~4、1~5、2~4、2~6、3~6等,以及该范围内的单个数值,例如,1、2、2.7、3、4、5、5.3和6。无论范围的广度如何,这都是适用的。
[0081] 方法
[0082] 本发明部分涉及制备式II的化合物的方法:
[0083]
[0084] 在式II的化合物中,y为整数0或1。在一些实施方案中,y为整数0。在其它实施方案中,y为整数1。在这些化合物中,x为1或2的整数。在一些实施方案中,x为整数1。在其它实施方案中,x为整数2。类似地,z为1或2的整数。在一些实施方案中,z为整数1。在其它实施方案中,z为整数2。在进一步的实施方案中,x和z二者不同时为2。
[0085] R1为任选取代的C1‑6烷基、任选取代的C2‑6烯基、任选取代的C2‑6炔基、或任选取代1
的芳基。在一些实施方案中,R为任选取代的C1‑6烷基,例如甲基、乙基、丙基、丁基、戊基或
1
己基。在其它实施方案中,R为任选取代的C2‑6烯基,例如乙烯基、丙烯基、丁烯基、戊烯基或
1
己烯基。在进一步的实施方案中,R 为任选取代的C2‑6炔基,例如乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊
1 2
炔基或己炔基。在又一些其它实施方案中,R为任选取代的芳基,例如苯基。R 为不存在、H、任选取代的C1‑6烷基、任选取代的C2‑6烯基、任选取代的C2‑6炔基或任选取代的芳基。在一些
2 2 2
实施方案中,R不存在。在其它实施方案中,R为H。在进一步的实施方案中,R为任选取代的
2
C1‑6烷基,例如甲基、乙基、丙基、丁基、戊基或己基。在其它实施方案中,R 为任选取代的C2‑6
2
烯基,例如乙烯基、丙烯基、丁烯基、戊烯基或己烯基。在进一步的实施方案中,R 为任选取
2
代的C2‑6炔基,例如乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊炔基或己炔基。在又一些其它实施方案中,R
1 2 1
为任选取代的芳基,例如苯基。R和R可以被一个或多个基团取代。在一些实施方案中,R
2 1 2
和/或R独立地被1个、2个、3个、4个或5个基团取代。在一些实施方案中,如果R和R被取代,则取代基可以相同或可以不同。
[0086] 在某些实施方案中,R1和R2独立地被以下基团取代:C0‑6烷基OH、C0‑6烷基SH、C0‑6烷基NH2、C0‑6烷基‑O‑C0‑6烷基、C0‑6烷基‑S‑C0‑6烷基、C0‑6烷基C(O)OH、C0‑6烷基C(O)(C1‑6烷基)、C0‑6烷基C(O)O(C1‑6烷基)、C0‑6烷基N3、C0‑6烷基C(O)NH2、C0‑6烷基‑C(O)N(C1‑6烷基)OH、任选取代的C3‑7环烷基、任选取代的C5‑7环烯基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的杂环基、‑NHC(NH2)(=N(C0‑6烷基)、‑NHC(NH2)(=S(C0‑6烷基)、核碱基、或氨基酸;其中所述7
烷基、烯基或炔基的任意碳原子任选地被杂原子取代,所述杂原子为O、S、SO、SO2或NR 。在其
1 2 1
它实施方案中,R 和R独立地被C0‑6烷基OH例如OH或CH2OH取代。在进一步的实施方案中,R
2 1 2
和R 独立地被C0‑6烷基SH例如SH和CH2SH取代。在又一些其它实施方案中,R 和R 独立地被C0‑6烷基NH2例如NH2、甲胺、乙胺、丙胺、N,N‑二甲基甲胺、二甲胺或N,N,N‑三甲基甲胺取代。
1 2
在更进一步的实施方案中,R 和R 独立地被C0‑6烷基‑O‑C0‑6烷基例如‑O‑C1‑6烷基或OCH3取
1 2
代。在其它实施方案中,R和R 独立地被C0‑6烷基‑S‑C0‑6烷基例如‑S‑C1‑6烷基或例如‑SCH3取
1 2
代。在进一步的实施方案中,R 和R 独立地被C0‑6烷基C(O)OH例如C(O)OH、乙酸(ethanoic 
1 2
acid)、乙酸(acetic acid)或丙酸取代。在另外的其它实施方案中,R和R独立地被C0‑6烷基C(O)(C1‑6烷基)例如‑C(O)(C1‑6烷基)、或例如‑CH2‑C(O)(C1‑6烷基)、或例如‑C(O)CH3取代。在
1 2
又进一步的实施方案中,R和R独立地被C0‑6烷基C(O)O(C1‑6烷基)例如甲酸甲酯或乙酸甲酯
1 2
取代。在其它实施方案中,R和R 独立地被C0‑6烷基N3例如N3或例如‑CH2N3取代。在进一步的
1 2
实施方案中,R 和R 独立地被C0‑6烷基C(O)NH2例如C(O)NH2、或例如乙酰胺或丙酰胺取代。在
1 2
另外的其它实施方案中,R和R独立地被C0‑6烷基‑C(O)N(C1‑6烷基)OH例如‑C(O)N(C1‑6烷基)OH、或例如‑C(O)N(CH3)OH、或例如甲羟酰胺、乙羟酰胺或丙羟酰胺取代。在又进一步的实施
1 2
方案中,R 和R独立地被任选取代的C3‑7环烷基例如环丙基、环丁基、环戊基、环己基或环庚
1 2
基、或例如环丙基、或例如环丁基取代。在其它实施方案中,R和R 独立地被任选取代的C5‑7
1 2
环烯基例如环戊烯基、环己烯基或环庚烯基取代。在进一步的实施方案中,R 和R独立地为任选取代的芳基,例如苯基、对甲酚、1‑甲氧基‑苄基、萘基、4‑甲基‑苯酚或1‑甲氧基‑4‑甲
1 2
基‑苯)、或例如苯基。在另外的其它实施方案中,R和R独立地为任选取代的杂芳基,例如咪唑基、2‑芘基、1‑甲基咪唑基、吲哚基、吡啶基例如2‑吡啶基、3‑吡啶基或4‑吡啶基、三唑基、
1 2
或咪唑基。在又进一步的实施方案中,R 和R 独立地为任选取代的杂环基例如氮杂环丁烷
基、二噁烷基、四氢吡喃基、吡咯烷基、哌啶基、吗啉基、哌嗪基、吡咯烷基、吲哚啉基、氧杂环丁烷基、四氢呋喃基、四氢噻吩基、2‑吡唑啉基、吡唑烷基、三噻烷基、吲哚嗪基、苯并[b]噻吩基、1H‑吲唑基、苯并噻唑基、4H‑喹嗪基、喹啉基、1,2,3,4‑四氢喹啉基、异喹啉基、1,2,3,
1 2
4‑四氢异喹啉基、喹喔啉基、吩噻嗪基。在其它实施方案中,R和R 独立地为‑NHC(NH2)(=N
1 2
(C0‑6烷基),例如胍基、甲基‑胍基、乙基‑胍基或丙基‑胍基。在进一步的实施方案中,R和R
1
独立地为‑NHC(NH2)(=S(C0‑6烷基),例如甲基‑硫脲或乙基‑硫脲。在一些实施方案中,R 和
2
R可以用可除去的保护基团来保护。例如,反应性氮可以使用Alloc基团来保护。
[0087] 在又一些其它实施方案中,R1和R2独立地为核碱基。此类核碱基的实例包括但不限于鸟嘌呤基、腺嘌呤基、胞嘧啶基、胸腺嘧啶基、或其任意组合。
[0088] 在另外的其它实施方案中,R1和R2独立地为氨基酸、糖、或其任意组合。在一些实施方案中,氨基酸为β‑氨基酸。氨基酸的实例包括但不限于精氨酸(Arg)、组氨酸(His)、赖氨酸(Lys)、天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu)、丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、天冬酰胺(Asn)、谷氨酰胺(Gln)、半胱氨酸(Cys)、硒代半胱氨酸(Sec)、甘氨酸(Gly)、脯氨酸(Pro)、丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)、异亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)、甲硫氨酸(Met)、苯丙氨酸(Phe)、酪氨酸(Tyr)、色氨酸(Trp)、吡咯赖氨酸、或其任意组合。
[0089] 在进一步的实施方案中,R1和R2与它们所连接的碳连接在一起以形成C3‑8环烷基例1 2
如环丙基、环丁基或环戊基。在一些实施方案中,R和R连接在一起以形成环丙基。在其它实
1 2 1 2
施方案中,R 和R连接在一起以形成环丁基。在进一步的实施方案中,R 和R连接在一起以
1 2
形成环戊基。在又一些其它实施方案中,R和R连接在一起以形成环己基。
[0090] 在某些实施方案中,烷基、烯基或炔基的任意碳原子任选地被O、S、SO、SO2、或NR7替代。在一些实施方案中,烷基、烯基或炔基的任意碳原子任选地被O杂原子替代。在进一步的实施方案中,烷基、烯基或炔基的任意碳原子任选地被S杂原子替代。在又一些其它实施方案中,烷基、烯基或炔基的任意碳原子任选地被SO基团替代。在更进一步的实施方案中,烷基、烯基或炔基的任意碳原子任选地被SO2基团替代。在其它实施方案中,烷基、烯基或炔基7
的任意碳原子任选地被NR例如NH、或例如N(C1‑4烷基)、或例如NCH3替代。
[0091] R7为H、C1‑4烷基、C3‑4烯基、C3‑4炔基、或C1‑4桥连烷基,其中在含有所述杂原子的链1
的氮原子和碳原子之间形成桥,从而形成环,其中所述环任选地与Ar稠合。在一些实施方
7 7 7
案中,R为H。在其它实施方案中,R 为C1‑4烷基,例如CH3。在进一步的实施方案中,R为C3‑4烯
7 7
基。在又一些其它实施方案中,R为C3‑4炔基。在更进一步的实施方案中,R为C1‑4桥连烷基,其中在所述含有杂原子的链的氮原子和碳原子之间形成桥,从而形成环,其中所述环任选
1
地与Ar稠合。
[0092] Ar1为C3‑6环烷基、芳基、杂环基、或杂芳基。在一些实施方案中,Ar1为C3‑6环烷基,例1
如环丙基、环丁基、环戊基、或环己基。在其它实施方案中,Ar为芳基,例如苯基、1‑萘基、2‑
1
萘基、茚基、薁基、芴基、或蒽基。在进一步的实施方案中,Ar为杂环基,例如氮杂环丁烷基、
1
吖丙啶基、哌啶基、或氮杂环庚烷基。在另外的其它实施方案中,Ar为杂芳基,例如吖啶基、苯并咪唑基、苯并噻唑基、苯并[b]呋喃基、苯并[b]噻吩基、咔唑基、噌啉基、呋喃基例如2‑呋喃基或3‑呋喃基、咪唑基、1H‑吲唑基、吲哚嗪基、吲哚基例如3H‑吲哚基、吲哚啉基、异吲哚基、异喹啉基、异噁唑基、1,8‑萘啶基、噁二唑基例如1,2,3‑噁二唑基、噁唑基、吩嗪基、吩噻嗪基、吩噁嗪基、蝶啶基、嘌呤基、吡嗪基、吡唑基、2‑吡唑啉基、吡唑烷基、哒嗪基、嘧啶基、吡啶基例如2‑吡啶基、3‑吡啶基或4‑吡啶基、吡咯基、4H‑喹嗪基、喹啉基、酞嗪基、喹唑啉基、喹喔啉基、1,2,3,4‑四氢喹啉基、1,2,3,4‑四氢异喹啉基、1,3,4‑噻二唑基、噻唑基、
1,2,3‑三唑基、1,3,5‑三嗪基、1,3,5‑三噻烷基、或噻吩基例如2‑噻吩基或3‑噻吩基。
[0093] Ar1任选地被以下基团中的一种或多种取代:H、卤素、OH、NO2、‑SO3H、CF3、OCF3、C1‑6烷基例如CH3、C2‑6烯基、C1‑6烷氧基例如OCH3、O‑C3‑4烯基、‑O‑苄基、‑O‑苯基、1,2‑亚甲二氧5 6
基、‑NR R、‑C(O)OH、‑C(O)(C1‑6烷基)、C(O)O(C1‑6烷基)、甲酰胺例如C(O)NH(C1‑6烷基)、‑C(O)NH(C3‑5烯基)、‑C(O)N(C1‑6烷基)(C1‑6烷基)、‑C(O)(C3‑5烯基)(C3‑6烯基)、吗啉基、哌啶
2 2 2 2 2 5 6
基、‑O‑Ar、‑CH2‑(CH2)q‑Ar、‑O‑(CH2)q‑Ar、‑(CH2)q‑O‑Ar 、或‑CH=CH‑Ar。R 和R 独立地为
2
H、C1‑6烷基、C3‑6烯基、C3‑6炔基、或苄基。Ar为4‑甲氧基苯基、2‑吡啶基、3‑吡啶基、4‑吡啶基、吡唑基、喹啉基、3,5‑二甲基异噁唑基、2‑甲基噻唑基、噻唑基、2‑噻吩基、3‑噻吩基或嘧啶基。q为整数0至2。
[0094] 在式II的化合物中,X为离去基团。本领域技术人员将能够容易地确定用作“X”的合适的离去基团。在一些实施方案中,X为卤素或磺酸酯。在其它实施方案中,X为卤素,例如氯、氟或溴。在进一步的实施方案中,X为磺酸酯,例如对甲苯磺酸酯(OTs)、甲磺酸酯(OMs)4 4
或三氟甲磺酸酯(OTf)。式II的化合物中的R为保护基团。在一些实施方案中,R 为C1‑6烷基或4‑{N‑[1‑(4,4‑二甲基‑2,6‑二氧代环己叉基)‑3‑甲基丁基]氨基}苄基酯(DMab)。在其它
4
实施方案中,R为C1‑6烷基,例如叔丁基。
[0095] 在某些方面,式II的化合物具有式II‑A的结构。
[0096]
[0097] 在进一步的方面,式II的化合物具有式II‑A的结构。在其它方面,式II的化合物具有式II‑B的结构。在进一步的方面,式II的化合物具有式II‑C的结构。
[0098] 通过使式I的化合物与R1X、R1C(O)H或R1C(O)R2在还原剂的存在下、在有效产生式II的化合物的条件下接触一段时间来制备式II的化合物:
[0099]
[0100] 在一些实施方案中,当使式I的化合物与R1X反应时,y为整数0并且R2不存在。
[0101] 用于制备式II的化合物的有机溶剂可以由本领域技术人员选择。在一些实施方案中,有机溶剂为极性有机溶剂。在其它实施方案中,有机溶剂为醇类溶剂例如甲醇、醚类溶剂例如四氢呋喃、或乙酸乙酯。用于形成式II的化合物的还原剂可以由本领域技术人员选
择。在一些实施方案中,还原剂为NaBH3、NaBH3CN或Na(CH3COO)3BH。在其它实施方案中,还原剂为NaBH3CN。
[0102] 在一些方面,式I的化合物具有式I‑A的结构:
[0103]
[0104] 在进一步的方面,式I的化合物具有式I‑A的结构。在其它方面,式I的化合物具有式I‑B的结构。在进一步的方面,式I的化合物具有式I‑C的结构。
[0105] 可以通过使式III的化合物与螯合剂在有效产生式I的化合物的条件下接触一段时间来制备式I的化合物:
[0106]
[0107] 其中,M为具有+2氧化态的过渡金属。在一些实施方案中,M为钒、锰、铁、钴、镍、铜或锌。在其它实施方案中,M为铜。在进一步的实施方案中,M为锰。在又一些其它实施方案中,M为铁。在更进一步的实施方案中,M为钴。在其它实施方案中,M为镍。在进一步的实施方案中,M为锌。
[0108] 用于制备式I的化合物的螯合剂可以由本领域技术人员选择。在一些实施方案中,螯合剂为乙二胺四乙酸(EDTA)、二亚乙基三胺五乙酸(DTPA)或羟乙基乙二胺三乙酸
(HEDTA)、或其盐。在进一步的实施方案中,螯合剂为Na2EDTA·H2O或CaNa2EDTA。在其它实施方案中,螯合剂为H2S、噻唑烷硫酮、甘氨酸和/或其它螯合剂。
[0109] 用于制备式I的化合物的有机溶剂可以由本领域技术人员选择。在一些实施方案中,有机溶剂为极性有机溶剂。在其它实施方案中,有机溶剂为醚类溶剂、氯化有机溶剂、或其组合。在进一步的实施方案中,有机溶剂为醚类溶剂例如甲基叔丁基醚。在另外的其它实施方案中,有机溶剂为氯化有机溶剂,为氯仿。在又进一步的实施方案中,有机溶剂为甲基叔丁基醚和氯仿的混合物。当利用溶剂的组合/混合物时,比例为约1:1至约1:5。在一些实施方案中,甲基叔丁基醚与氯仿的比例为约1:1至约1:5。
[0110] 在一些方面,化合物具有式III‑A、式III‑B、式III‑C、式III‑D、式III‑E、式III‑F、或式III‑G的结构:
[0111]
[0112]
[0113]
[0114] 在进一步的方面,式III的化合物具有式III‑A的结构。在其它方面,式III的化合物具有式III‑B的结构。在进一步的方面,式III的化合物具有式III‑C的结构。在又一些其它方面中,式III的化合物具有式III‑D的结构。在更进一步的方面,式III的化合物具有式III‑E的结构。在其它方面,式III的化合物具有式III‑F的结构。在进一步的方面,式III的化合物具有式III‑G的结构。
[0115] 通过使式IV的化合物与9‑芴基甲氧基碳酰氯在有效产生式IV的化合物的条件下接触一段时间来制备式III的化合物:
[0116]
[0117] 用于制备式IV的化合物的有机溶剂为极性有机溶剂。在一些实施方案中,有机溶剂为乙酸乙酯或能够使反应发生的任何极性相似的溶剂。在一些实施方案中,有机溶剂允
许反应发生。在一些方面,式IV的化合物具有式IV‑A、式IV‑B、式IV‑C、式IV‑D、式IV‑E、式IV‑F或式IV‑G的结构:
[0118]
[0119] 在进一步的方面,式IV的化合物具有式IV‑A的结构。在其它方面,式IV的化合物具有式IV‑B的结构。在进一步的方面,式IV的化合物具有式IV‑C的结构。在又一些其它方面中,式IV的化合物具有式IV‑D的结构。在更进一步的方面,式IV的化合物具有式IV‑E的结构。在其它方面,式IV的化合物具有式IV‑F的结构。在进一步的方面,式IV的化合物具有式IV‑G的结构。
[0120] 通过使式V的化合物与金属(II)源在有效产生式IV的化合物的条件下接触一段时间来制备式IV的化合物:
[0121]
[0122] 在一些实施方案中,金属(II)源为Ni(II)源或铜(II)源。在其它实施方案中,金属源为铜(II)源例如铜(II)盐。在进一步的实施方案中,金属(II)源为Ni(II)源。在另外的其它实施方案中,铜(II)盐例如氯化铜或硫酸铜。溶剂可以由本领域技术人员选择。在一些实施方案中,溶剂为水。在其它实施方案中,溶剂任选地为水与一种或多种有机共溶剂的混合物。
[0123] 在一些方面,式V的化合物具有式V‑A、式V‑B或式V‑C的结构:
[0124]
[0125] 在进一步的方面,式V的化合物具有式V‑A的结构。在其它方面,式V的化合物具有式V‑B的结构。在进一步的方面,式V的化合物具有式V‑C的结构。
[0126] 可以使式II的化合物与式VI‑A、式VI‑B或式VI‑C的化合物、活化剂和碱接触以提供中间体:
[0127]
[0128] 在某些实施方案中,使式II的化合物与式VI‑A的化合物接触。在其它实施方案中,使式II的化合物与式VI‑B的化合物接触。在进一步的实施方案中,使式II的化合物与式VI‑C的化合物接触。
[0129] 在一些实施方案中,AA为任选取代的氨基酸。氨基酸可以由本领域技术人员选择。在一些方面,AA为天然氨基酸或非天然氨基酸。在某些方面,AA为精氨酸(Arg)、组氨酸
(His)、赖氨酸(Lys)、天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu)、丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、天冬酰胺(Asn)、谷氨酰胺(Gln)、半胱氨酸(Cys)、硒代半胱氨酸(Sec)、甘氨酸(Gly)、脯氨酸(Pro)、丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)、异亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)、甲硫氨酸(Met)、苯丙氨酸
(Phe)、酪氨酸(Tyr)、色氨酸(Trp)、或吡咯赖氨酸。在某些方面,AA为甘氨酸。在其它方面,AA为丙氨酸。在进一步的方面,AA为缬氨酸。在又一些其它方面中,AA为亮氨酸。在更进一步的方面,AA为异亮氨酸。在其它方面,AA为脯氨酸。在进一步的方面,AA为丝氨酸。在又一些其它方面中,AA为苏氨酸。在更进一步的方面,AA为天冬酰胺。在其它方面,AA为谷氨酰胺。
在进一步的方面,AA为半胱氨酸。在另外的其它方面,AA为甲硫氨酸。在又进一步的方面,AA为苯丙氨酸。在其它方面,AA为酪氨酸。在进一步的方面,AA为色氨酸。在又一些其它方面中,AA为天冬氨酸。在更进一步的方面,AA为谷氨酸。在其它方面,AA为组氨酸。在进一步的方面,AA为赖氨酸。在又一些其它方面中,AA为精氨酸。在更进一步的方面,AA为硒代半胱氨酸。在其它方面,AA为吡咯赖氨酸。在进一步的方面,AA为β‑丙氨酸。
[0130] AA还可以选自非天然氨基酸,例如PABA、别异亮氨酸、别苏氨酸、羧基谷氨酸、胱硫醚、D‑丙氨酸、脱氢丙氨酸、D‑谷氨酸、二氨基庚二酸、黎豆氨酸、甘氨酸甜菜碱同型半胱氨酸、同型正亮氨酸、同型丝氨酸、羟基甘氨酸、羟基脯氨酸、羟腐胺赖氨酸、异丝氨酸、异缬氨酸、羊毛硫氨酸、N‑乙基丙氨酸、N‑乙基甘氨酸、N‑乙基β‑丙氨酸、N‑异丙基甘氨酸、N‑甲基丙氨酸、N‑甲基β‑丙氨酸、正亮氨酸、正缬氨酸、N‑丙基甘氨酸、O‑甲基‑同型丝氨酸、鸟氨酸、哌啶酸、焦谷氨酸、肌氨酸、硒代半胱氨酸、硒代同型半胱氨酸、硒代甲硫氨酸、硒代乙硫氨酸、牛磺酸、叔亮氨酸、α,β‑二氨基丙酸、α,γ‑二氨基丁酸、α‑氨基异丁酸、α‑氨基‑正丁酸、α‑氨基‑正庚酸、α‑羟基‑γ‑氨基丁酸、β‑丙氨酸、β‑氨基异丁酸、β‑氨基‑正丁酸、γ‑氨基丁酸、δ‑氨基乙酰丙酸、1‑氨基环丙烷‑1‑羧酸、氮杂环丁烷‑2‑羧酸、环亮氨酸、或伪脯氨酸。在一些方面,AA为PABA。在其它方面,AA为别异亮氨酸。在进一步的方面,AA为别苏氨酸。在又一些其它方面中,AA为羧基谷氨酸。在更进一步的方面,AA为胱硫醚。在其它方面,AA为D‑丙氨酸。在进一步的方面,AA为脱氢丙氨酸。在又一些其它方面中,AA为D‑谷氨酸。在更进一步的方面,AA为二氨基庚二酸。在又进一步的方面,AA为黎豆氨酸。在其它方面,AA为甘氨酸甜菜碱同型半胱氨酸。在进一步的方面,AA为同型正亮氨酸。在又一些其它方面中,AA为同型丝氨酸。在更进一步的方面,AA为羟基甘氨酸。在其它方面,AA为羟基脯氨酸。在进一步的方面,AA为羟腐胺赖氨酸。在另外的其它方面,AA为异丝氨酸。在又进一步的方面,AA为异缬氨酸。在其它方面,AA为羊毛硫氨酸。在进一步的方面,AA为N‑乙基丙氨酸。在另外的其它方面,AA为N‑乙基甘氨酸。在又进一步的方面,AA为N‑乙基β‑丙氨酸。在其它方面,AA为N‑异丙基甘氨酸。在进一步的方面,AA为N‑甲基丙氨酸。在另外的其它方面,AA为N‑甲基β‑丙氨酸。在又进一步的方面,AA为正亮氨酸。在其它方面,AA为正缬氨酸。在进一步的方面,AA为N‑丙基甘氨酸。在又一些其它方面中,AA为O‑甲基‑同型丝氨酸。在更进一步的方面,AA为鸟氨酸。在其它方面,AA为哌啶酸。在进一步的方面,AA为焦谷氨酸。在又一些其它方面中,AA为肌氨酸。在更进一步的方面,AA为硒代半胱氨酸。在其它方面,AA为硒代同型半胱氨酸。在进一步的方面,AA为硒代甲硫氨酸。在又一些其它方面中,AA为硒代乙硫氨酸。在更进一步的方面,AA为牛磺酸。在其它方面,AA为叔亮氨酸。在进一步的方面,AA为α,β‑二氨基丙酸。
在又一些其它方面中,AA为α,γ‑二氨基丁酸。在更进一步的方面,AA为α‑氨基异丁酸。在其它方面,AA为α‑氨基‑正丁酸。在进一步的方面,AA为α‑氨基‑正庚酸。在又一些其它方面中,AA为α‑羟基‑γ‑氨基丁酸。在更进一步的方面,AA为β‑丙氨酸。在其它方面,AA为β‑氨基异丁酸。在进一步的方面,AA为β‑氨基‑正丁酸。在又一些其它方面中,AA为γ‑氨基丁酸。在更进一步的方面,AA为δ‑氨基乙酰丙酸。在其它方面,AA为1‑氨基环丙烷‑1‑羧酸。在进一步的方面,AA为氮杂环丁烷‑2‑羧酸。在另外的其它方面,AA为环亮氨酸。在又进一步的方面,AA
4
为伪脯氨酸。氨基酸连接至与R 基团结合的氧原子。氨基酸可以通过氨基酸骨架的任何位
置与氧原子结合。例如,在一些实施方案中,氨基酸通过氨基酸的羰基连接至氧原子。
[0131] 在这些结构中,R5为树脂。适合用于本文中的树脂可以由本领域技术人员选择。在一些实施方案中,树脂包含羧基。理想地,树脂包含可裂解基团。如本文中所使用的术语“可裂解基团”是指从式V‑C的化合物中被置换出来的基团。特别地,可裂解基团从式V‑C的化合物中被置换出来,以使AA可以连接。在一些实施方案中,可裂解基团为OH或羧基。在其它实施方案中,可裂解基团为OH。在进一步的实施方案中,可裂解基团为羧基。在又一些其它实施方案中,可裂解基团为聚苯乙烯树脂。
[0132] 所利用的活化剂可以由本领域技术人员选择。
[0133] 在一些方面,活化剂为1‑氰基‑2‑乙氧基‑2‑氧代亚乙基氨基氧基)二甲基氨基‑吗啉代‑碳鎓六氟磷酸盐(1‑cyano‑2‑ethoxy‑2‑oxoethylidenaminooxy)dimethylamino‑morpholino‑carbenium hexafluorophosphate,COMU)、1H‑1,2,3‑苯并三唑‑l‑基氧基‑三(吡咯烷基)‑ 六氟磷酸盐(PyBOP)、1‑羟基‑7‑氮杂苯并三唑(HOAt)、2‑(1H‑7‑氮杂苯并三唑‑1‑基)‑1,1,3‑四甲基脲六氟磷酸盐(HATU)、苯并三唑‑1‑基‑氧基‑三(二甲基氨基) 六氟磷酸盐(BOP)、氯‑N,N,N’,N'‑四甲基甲脒六氟磷酸盐、二环己基碳二亚胺(DCC)、二异丙2
基碳二亚胺(DIC)、氰基(羟基亚氨基)乙酸乙酯基‑O]三‑1‑吡咯烷基 六氟磷酸盐(ethyl 
2
cyano(hydroxyimino)acetato‑O ]tri‑1‑pyrrolidinylphosphonium 
hexafluorophosphate,PyOxim)、氰基羟基亚氨基乙酸乙酯(Oxyma)、N,N'‑二异丙基碳二亚胺(DIC)、N‑羟基苯并三唑(HOBT)、O‑(1H‑苯并三唑‑1‑基)‑N,N,N’,N'‑四甲基脲四氟硼酸盐(TBTU)、O‑1,1,3,3‑四甲基脲六氟磷酸盐(HCTU)或O‑苯并三唑‑N,N,N’,N'‑四甲基脲六氟磷酸盐(HBTU)、或其组合。在一些方面,活化剂为COMU。在其它方面,活化剂为PyBOP。在进一步的方面,活化剂为HOAt。在又一些其它方面中,活化剂为HATU。在更进一步的方面,活化剂为BOP。在其它方面,活化剂为氯‑N,N,N’,N'‑四甲基甲脒六氟磷酸盐。在进一步的方面,活化剂为DCC。在又一些其它方面中,活化剂为DIC。在更进一步的方面,活化剂为PyOxim。在其它方面,活化剂为Oxyma。在进一步的方面,活化剂为DIC。在另外的其它方面,活化剂为HOBT。在又进一步的方面,活化剂为TBTU。在其它方面,活化剂为HCTU。在进一步的方面,活化剂为HBTU。
[0134] 用于该转化的溶剂可以由本领域技术人员选择。优选地,溶剂是极性的。溶剂的实例包括NMP、DMF、DMSO、DCM或其混合物。在一些方面,溶剂为NMP。在其它方面,溶剂为DMF。在进一步的方面,溶剂为DMSO。在又一些其它方面中,溶剂为DCM。
[0135] 然后使中间体与脱保护剂在有效产生式VII的化合物的条件下接触一段时间:
[0136]
[0137] 在一些实施方案中,将中间体转化为式VII‑A、式VII‑B或式VII‑C的化合物:
[0138]
[0139] 在一些实施方案中,将中间体转化为式VII‑A的化合物。在其它实施方案中,将中间体转化为式VII‑B的化合物。在进一步的实施方案中,将中间体转化为式VII‑C的化合物。
[0140] 本领域技术人员将能够选择合适的脱保护剂。在一些实施方案中,脱保护剂为碱。碱的实例包括哌啶、4‑甲基哌啶、哌嗪、1,8‑二氮杂双环[5.4.0]十一碳‑7‑烯(DBU)或吗啉、或其组合而没有限制。在某些方面,碱为哌啶。在其它方面,碱为4‑甲基哌啶。在进一步的方面,碱为哌嗪。在又一些其它方面中,碱为DBU。在更进一步的方面,碱为吗啉。
[0141] 然后将式VII的化合物转化为式VIIIA、式VIII‑B或式VIII‑C的化合物:
[0142]
[0143] 在一些实施方案中,将式VII‑A的化合物转化为式VIII‑A的化合物。在其它实施方案中,将式VII‑B的化合物转化为式VIII‑B的化合物。在进一步的实施方案中,将式VII‑C的化合物转化为式VIII‑C的化合物。
[0144] 通过使式VII的化合物与式II的化合物在如上所述的活化剂的存在下接触来进行此类转化。此后,使反应与如上所述的脱保护剂在有效产生式VIII‑A、式VIII‑B或式VIII‑C的化合物的条件下接触一段时间。
[0145] 有利地,可以使式VIII‑A、式VIII‑B或式VIII‑C的化合物与式II的化合物进一步反应以提供相应的更大的化合物,例如式XV‑A、式XV‑B或式XV‑C的化合物:
[0146]
[0147] 在其它实施方案中,可以制备XV‑A的化合物。在进一步的实施方案中,可以制备XV‑B的化合物。在又一些其它实施方案中,可以制备XV‑C的化合物。
[0148] 作为一般原则,这些更大的化合物通过使涉及式II的化合物的各反应的产物与另一式II的化合物反应来形成。进行与式II的化合物的反应的次数(“w”次)由所需化合物的大小来确定。在某些实施方案中,使产物与式II的化合物反应1至20次(即,w为1至20的整
数)。在其它实施方案中,w为整数1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或
20。在进一步的实施方案中,w为2至18、2至16、2至14、2至12、2至10、2至8、2至6、2至4、4至
20、4至18、4至16、4至14、4至12、4至10、4至8、4至6、6至20、6至18、6至16、6至14、6至12、6至
10、6至8、8至20、8至18、8至16、8至14、8至12、8至10、10至20、10至18、10至16、10至14、10至
12、12至20、12至18、12至16、12至14、14至20、14至18、14至16、16至20、16至18、或18至20的整数。在又一些其它实施方案中,w为1至8的整数。在更进一步的实施方案中,w为6至8。
[0149] 然后,可以将式VIII‑A、式VIII‑B或式VIII‑C的化合物转化为式IX‑B、式IX‑B或式IX‑C的化合物:
[0150]
[0151] 在一些实施方案中,将式XIII‑A的化合物转化为式IX‑A的化合物。在其它实施方案中,将式VIII‑B的化合物转化为式IX‑B的化合物。在进一步的实施方案中,将式VIII‑C的化合物转化为式IX‑C的化合物。通过使式VIII‑A、式VIII‑B或式VIII‑C的化合物与式II的化合物在如上所述的活化剂的存在下接触来进行此类转化。此后,使反应与如上所述的脱保护剂在有效产生式IX‑A、式IX‑B或式IX‑C的化合物的条件下接触一段时间。
[0152] 然后可以将式IX‑A、式IX‑B或式IX‑C的化合物转化为式X‑B、式X‑B或式X‑C的化合物:
[0153]
[0154] 在一些实施方案中,将式IX‑A的化合物转化为式X‑A的化合物。在其它实施方案中,将式XIII‑A的化合物转化为式X‑B的化合物。在进一步的实施方案中,将式XIII‑A的化合物转化为式X‑C的化合物。
[0155] 通过使式IX‑A、式IX‑B或式IX‑C的化合物与式II的化合物在如上所述的活化剂的存在下接触来进行此类转化。此后,使反应与如上所述的脱保护剂在有效产生式X‑A、式X‑B或式X‑C的化合物的条件下接触一段时间。
[0156] 然后,可以将式X‑A、式X‑B或式X‑C的化合物转化为式XI‑B、式XI‑B或式XI‑C的化合物:
[0157]
[0158] 在一些实施方案中,将式X‑A的化合物转化为式XI‑A的化合物。在其它实施方案中,将式X‑B的化合物转化为式XI‑B的化合物。在进一步的实施方案中,将式X‑C的化合物转化为式XI‑C的化合物。
[0159] 通过与如本文中所述的活化剂和Y‑Z的反应将式X‑A、式X‑B或式X‑C的化合物转化为式XI‑A、式XI‑B或式XI‑C的化合物。将Y定义为氨基羰基并且Z为离去基团。如本文中所使用的术语“氨基羰基”是指包含NH2和C(O)基团的任何化学官能团。Y为H或氨基酸。在一些方面,Y为H。在其它方面,Y为氨基酸。氨基酸的实例包括本文中所述的那些。氨基酸可以由本领域技术人员选择。在一些方面,Y为天然氨基酸或非天然氨基酸。在某些方面,Y为Arg、His、Lys、Asp、Glu、Ser、Thr、Asn、Gln、Cys、Sec、Gly、Pro、Ala、Val、Ile、Leu、Met、Phe、Tyr、Trp或吡咯赖氨酸。在某些方面,Y为Gly。在其它方面,Y为Ala。在进一步的方面,Y为Val。在又一些其它方面中,Y为Leu。在更进一步的方面,Y为Ile。在其它方面,Y为Pro。在进一步的方面,Y为Ser。在又一些其它方面中,Y为Thr。在更进一步的方面,Y为Asp。在其它方面,Y为Gln。在进一步的方面,Y为Cys。在另外的其它方面,Y为Met。在又进一步的方面,Y为Phe。在其它方面,Y为Tyr。在进一步的方面,Y为Trp。在又一些其它方面中,Y为Asp。在更进一步的方面,Y为Glu。在其它方面,Y为His。在进一步的方面,Y为Lys。在又一些其它方面中,Y为Arg。在更进一步的方面,Y为硒代半胱氨酸。在其它方面,Y为吡咯赖氨酸。在进一步的方面,Y为β‑丙氨酸。
[0160] Y还可以选自非天然氨基酸,例如PABA、别异亮氨酸、别苏氨酸、羧基谷氨酸、胱硫醚、D‑丙氨酸、脱氢丙氨酸、D‑谷氨酸、二氨基庚二酸、黎豆氨酸、甘氨酸甜菜碱同型半胱氨酸、同型正亮氨酸、同型丝氨酸、羟基甘氨酸、羟基脯氨酸、羟腐胺赖氨酸、异丝氨酸、异缬氨酸、羊毛硫氨酸、N‑乙基丙氨酸、N‑乙基甘氨酸、N‑乙基β‑丙氨酸、N‑异丙基甘氨酸、N‑甲基丙氨酸、N‑甲基β‑丙氨酸、正亮氨酸、正缬氨酸、N‑丙基甘氨酸、O‑甲基‑同型丝氨酸、鸟氨酸、哌啶酸、焦谷氨酸、肌氨酸、硒代半胱氨酸、硒代同型半胱氨酸、硒代甲硫氨酸、硒代乙硫氨酸、牛磺酸、叔亮氨酸、α,β‑二氨基丙酸、α,γ‑二氨基丁酸、α‑氨基异丁酸、α‑氨基‑正丁酸、α‑氨基‑正庚酸、α‑羟基‑γ‑氨基丁酸、β‑丙氨酸、β‑氨基异丁酸、β‑氨基‑正丁酸、γ‑氨基丁酸、δ‑氨基乙酰丙酸、1‑氨基环丙烷‑1‑羧酸、氮杂环丁烷‑2‑羧酸、环亮氨酸、或伪脯氨酸。在一些方面,Y为PABA。在其它方面,Y为别异亮氨酸。在进一步的方面,Y为别苏氨酸。在又一些其它方面中,Y为羧基谷氨酸。在更进一步的方面,Y为胱硫醚。在其它方面,Y为D‑丙氨酸。在进一步的方面,Y为脱氢丙氨酸。在又一些其它方面中,Y为D‑谷氨酸。在更进一步的方面,Y为二氨基庚二酸。在又进一步的方面,Y为黎豆氨酸。在其它方面,Y为甘氨酸甜菜碱同型半胱氨酸。在进一步的方面,Y为同型正亮氨酸。在又一些其它方面中,Y为同型丝氨酸。在更进一步的方面,Y为羟基甘氨酸。在其它方面,Y为羟基脯氨酸。在进一步的方面,Y为羟腐胺赖氨酸。在另外的其它方面,Y为异丝氨酸。在又进一步的方面,Y为异缬氨酸。在其它方面,Y为羊毛硫氨酸。在进一步的方面,Y为N‑乙基丙氨酸。在另外的其它方面,Y为N‑乙基甘氨酸。在又进一步的方面,Y为N‑乙基β‑丙氨酸。在其它方面,Y为N‑异丙基甘氨酸。在进一步的方面,Y为N‑甲基丙氨酸。在另外的其它方面,Y为N‑甲基β‑丙氨酸。在又进一步的方面,Y为正亮氨酸。在其它方面,Y为正缬氨酸。在进一步的方面,Y为N‑丙基甘氨酸。在又一些其它方面中,Y为O‑甲基‑同型丝氨酸。在更进一步的方面,Y为鸟氨酸。在其它方面,Y为哌啶酸。
在进一步的方面,Y为焦谷氨酸。在又一些其它方面中,Y为肌氨酸。在更进一步的方面,Y为硒代半胱氨酸。在其它方面,Y为硒代同型半胱氨酸。在进一步的方面,Y为硒代甲硫氨酸。在又一些其它方面中,Y为硒代乙硫氨酸。在更进一步的方面,Y为牛磺酸。在其它方面,Y为叔亮氨酸。在进一步的方面,Y为α,β‑二氨基丙酸。在又一些其它方面中,Y为α,γ‑二氨基丁酸。在更进一步的方面,Y为α‑氨基异丁酸。在其它方面,Y为α‑氨基‑正丁酸。在进一步的方面,Y为α‑氨基‑正庚酸。在又一些其它方面中,Y为α‑羟基‑γ‑氨基丁酸。在更进一步的方面,Y为β‑丙氨酸。在其它方面,Y为β‑氨基异丁酸。在进一步的方面,Y为β‑氨基‑正丁酸。在又一些其它方面中,Y为γ‑氨基丁酸。在更进一步的方面,Y为δ‑氨基乙酰丙酸。在其它方面,Y为1‑氨基环丙烷‑1‑羧酸。在进一步的方面,Y为氮杂环丁烷‑2‑羧酸。在另外的其它方面,Y为环亮氨酸。在又进一步的方面,Y为伪脯氨酸。
[0161] 此后,在分别有效产生式XI‑A、式XI‑B或式XI‑C的化合物的条件下,添加如上所述的脱保护剂一段时间。
[0162] Z为离去基团,其可以由本领域技术人员选择。在一些实施方案中,Z为卤素、磺酸酯、N‑羟基苯并三唑基、1‑羟基‑7‑氮杂苯并三唑基、或 在其它实施方案中,Z为卤素,例如氯、氟或溴。在进一步的实施方案中,Z为磺酸酯例如对甲苯磺酸酯(OTs)、甲磺酸酯(OMs)、或三氟甲磺酸酯(OTf)。在又一些其它实施方案中,Z为N‑羟基苯并三唑基。在更进一步的实施方案中,Z为1‑羟基‑7‑氮杂苯并三唑基。在其它实施方案中,Z为
[0163] 然后,可以使式XI‑A的化合物与弱酸在足以产生式XII‑A的化合物的条件下接触一段时间:
[0164]
[0165] 在一些实施方案中,产生式XII‑A的化合物。
[0166] 转化中利用的弱酸可以由本领域技术人员选择。在一些实施方案中,弱酸为三氟乙酸或乙酸。在其它实施方案中,弱酸为三氟乙酸。在进一步的实施方案中,弱酸为乙酸。
[0167] 在一些实施方案中,弱酸的pH在约1至约7之间。在一些实施方案中,弱酸的pH在约2至约6之间。在一些实施方案中,弱酸的pH在约2至约5之间。在一些实施方案中,弱酸的pH在约3至约4之间。在一个实施方案中,弱酸的pH为约7。在一个实施方案中,弱酸的pH为约6。
在一个实施方案中,弱酸的pH为约5。在一个实施方案中,弱酸的pH为约4。在一个实施方案中,弱酸的pH为约3。在一个实施方案中,弱酸的pH为约2。在一个实施方案中,弱酸的pH为约
1。
[0168] 在一些实施方案中,弱酸的浓度为约50至约200mM。在更进一步的实施方案中,弱酸的浓度为约50mM、约75mM、约100mM、约125mM、约150mM、约175mM、或约200mM。在其它实施方案中,弱酸的浓度为约50至约175mM、约50至约150mM、约50至约125mM、约50至约100mM、约
50至约75mM、约75至约200mM、约75至约175mM、约75至约150mM、约75至约125mM、约75至约
100mM、约100至约200mM、约100至约175mM、约100至约150mM、约100至约125mM、约125至约
200mM、约125至约175mM、约125至约150mM、约150至约200mM、约150至约175mM、或约175至约
200mM。在进一步的实施方案中,弱酸为约50至约200mM乙酸。
[0169] 弱酸可以包含溶剂。此类溶剂的实例不限于甲醇、乙醇、异丙醇和/或丁醇等、和/或极性非质子溶剂例如二甲基甲酰胺、N‑甲基吡咯烷酮等。
[0170] 制备本文中所述的螺环化合物(包括式XII‑A的化合物)所需的时间的量为约1分钟至约24小时,优选约2至约12小时。在一些实施方案中,时间为约1分钟、约5分钟、约15分钟、约30分钟、约1小时、约2小时、约3小时、约4小时、约5小时、6小时、7小时、8小时、9小时、
10小时、约11小时、约12小时、约13小时、约14小时、约15小时、约16小时、约17小时、约18小时、约19小时、约20小时、约21小时、约22小时、约23小时、或约24小时。在其它实施方案中,时间为约1分钟至约18小时、约1分钟至约12小时、约1分钟至约8小时、约1分钟至约4小时、约1分钟至约1小时、约1分钟至约30分钟、约30分钟至约24小时、约30分钟至约18小时、约30分钟至约12小时、约30分钟至约8小时、约30分钟至约4小时、约30分钟至约1小时、约1小时至约24小时、约1小时至约18小时、约1小时至约12小时、约1小时至约8小时、约1小时至约4小时、约4小时至约24小时、约4小时至约18小时、约4小时至约12小时、约4小时至约8小时、约8小时至约24小时、约8小时至约18小时、约8小时至约12小时、约12小时至约24小时、约12小时至约18小时、或约18至约24小时。
[0171] 用于制备式XII‑A的化合物的温度为约室温至升高的温度。如本文中所使用的术语“室温”是指约30℃至约35℃的温度。在一些实施方案中,温度为约30至约60℃。在其它实施方案中,温度为约30℃、约35℃、约40℃、约45℃、约50℃、约55℃、或约60℃。在进一步的实施方案中,温度为约30℃至约55℃、约30℃至约50℃、约30℃至约45℃、约30℃至约40℃、约30℃至约35℃、约35℃至约60℃、约35℃至约55℃、约35℃至约50℃、约35℃至约45℃、约
35℃至约40℃、约40℃至约60℃、约40℃至约55℃、约40℃至约50℃、约40℃至约45℃、约45℃至约60℃、约45℃至约55℃、约45℃至约50℃、约50℃至约60℃、约50℃至约55℃、或约55℃至约60℃。
[0172] 本发明进一步提供用于制备式XV的化合物的方法:
[0173]
[0174] 在式XV的结构中,R1、R2、R4、x如本文中所定义。w为1至20的整数。在一些实施方案中,w为整数1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。在其它实施方案中,w为1至18、1至16、1至14、1至12、1至10、1至8、1至6、1至4、1至2、2至20、2至18、2至16、2至14、2至12、2至10、2至8、2至6、2至4、4至20、4至18、4至16、4至14、4至12、4至10、4至8、4至6、6至20、6至18、6至16、6至14、6至12、6至10、6至8、8至20、8至18、8至16、8至14、8至12、8至10、
10至20、10至18、10至16、10至14、10至12、12至20、12至18、12至16、12至14、14至20、14至18、
14至16、16至20、16至18、或18至20的整数。在式XV的化合物的结构中,y为整数0或1。在某些实施方案中,y为整数0。在其它实施方案中,y为整数1。
[0175] 用于制备式XV的化合物的方法包括式II的化合物与式VI的化合物,其中x、z、R1、2 5
R、R和AA如本文中所定义:
[0176]
[0177] 使用如本文中所定义的活化剂和如本文中所定义的碱来进行该方法,以提供中间体。然后使中间体与如本文中所定义的脱保护剂在有效产生式VII的化合物的条件下接触
一段时间:
[0178]
[0179] 然后使式VII的化合物与式II的化合物接触(w‑1)次,其中w在本文中定义。如本文中所使用的术语“w‑1”次意指使式VII的化合物与式II的化合物接触以提供第一中间体。然后使该第一中间体与式II的化合物接触以提供第二中间体等。在一些实施方案中,使式VII的化合物与式II的化合物接触1‑19次。在一些实施方案中,使式VII的化合物与式II的化合物接触1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18或19次。在其它实施方案中,使式VII的化合物与式II的化合物接触,w为1至18、1至16、1至14、1至12、1至10、1至8、1至6、1至4、1至2、2至20、2至18、2至16、2至14、2至12、2至10、2至8、2至6、2至4、4至20、4至18、4至16、4至14、4至12、4至10、4至8、4至6、6至20、6至18、6至16、6至14、6至12、6至10、6至8、8至
20、8至18、8至16、8至14、8至12、8至10、10至20、10至18、10至16、10至14、10至12、12至20、12至18、12至16、12至14、14至20、14至18、14至16、16至20、16至18、或18至20次的整数。
[0180] 本发明还提供用于制备式I的化合物的方法,其中x、z和R4如本文中所定义:
[0181]
[0182] 该方法包括接触式III的化合物,其中,M为如本文中所定义的具有+2氧化态的过渡金属:
[0183]
[0184] 使用如本文中所定义的螯合剂在有效产生式I的化合物的条件下进行该方法一段时间。
[0185] 本发明进一步提供用于制备式III的化合物的方法,其中X、Z和R4如本文中所定义:
[0186]
[0187] 该方法包括使式IV的化合物与9‑芴基甲氧基碳酰氯在有效产生式III的化合物的条件下接触一段时间。
[0188] 本发明进一步提供用于制备式IV的化合物的方法,其中x、z和R4如本文中所定义:
[0189]
[0190] 该方法包括使式V的化合物与如本文中所定义的金属(II)源接触:
[0191]
[0192] 在有效产生式IV的化合物的条件下进行该方法一段时间。
[0193] 本发明还提供用于制备式VII的化合物的方法,其中x、y、z、R4、R5和AA如本文中所定义:
[0194]
[0195] 该方法包括使式II的化合物与式VI的化合物接触:
[0196]
[0197] 使用如本文中所定义的活化剂和如本文中所定义的碱来提供中间体、并且使中间体与如本文中所定义的脱保护剂在有效产生式VII的化合物的条件下接触一段时间来进行
该方法。
[0198] 化合物
[0199] 有利地,本文中所述的方法允许制备无限数量的化合物。在某些实施方案中,本发明提供式XIV的化合物:
[0200]
[0201] 在该结构中,R1、R2、X、y和z的各实例独立地在本文中定义。
[0202] 还提供式II的化合物或其盐,其中y、R1、R2和R4如本文中所定义:
[0203]
[0204] 本发明还提供式II‑A、式II‑B或式II‑C的化合物,其中R1和R4如本文中所定义:
[0205]
[0206] 在一些实施方案中,化合物为式II‑A的化合物。在其它实施方案中,化合物为式II‑B的化合物。在进一步的实施方案中,化合物为式II‑C的化合物。
[0207] 在又一些其它实施方案中,化合物为:
[0208]
[0209]
[0210]
[0211] 在更进一步的化合物中,本发明提供一种化合物,所述化合物为:
[0212]
[0213] 本发明进一步提供一种化合物,所述化合物为:
[0214]
[0215] 本发明还提供一种化合物,所述化合物为:
[0216]
[0217] 应当理解,虽然已经结合本发明的优选的具体实施方案描述了本发明,但是前述描述和随后的实施例旨在说明并且不限制本发明的范围。本领域技术人员将理解,在不偏
离本发明的范围的情况下,可以做出各种改变并且可以替换等同物,进一步,其它方面、优点和修改对于本发明所属领域技术人员将是显而易见的。除了本文中描述的实施方案以
外,本发明考虑并且请求保护由本文中引用的本发明特征与补充本发明特征的所引用的现
有技术参考文献的特征的组合得出的那些发明。
[0218] 本文件中引用或描述的各专利、专利申请和出版物的本发明各自以其整体通过引用在此并入本文用于所有目的。
[0219] 实验例
[0220] 通过参考以下实验例进一步详细地描述本发明。这些实施例仅出于说明的目的而提供,并且除非另有说明,否则不旨在限制。因此,本发明绝不应当被解释为限于以下实施例,而是应当被解释为涵盖由于本文中提供的教导而变得显而易见的任何和所有变化。
[0221] 无需进一步描述,认为本领域普通技术人员可以使用前述描述和以下说明性实施例来做出和利用本发明并且实施请求保护的方法。因此,以下实施例具体地指出本发明的
优选实施方案,并且不应被解释为以任何方式限制本公开的其余部分。
[0222] 实施例1:Fmoc保护的双氨基酸向高度官能化螺环低聚物的自动合成的发展
[0223] “分子结构决定功能”–这是分子生物学的最基本范例(Gutteridge,A.等人,Trends in Biochemical Sciences 2005,30(11),622‑629)。大分子化学的目标是创造越
来越大的分子,控制它们的三维结构和它们所呈现的官能团的系列组合(constellation)
(Lenci,E.等人,Chemical Society Reviews 2020,49(11),3262‑3277;Lutz,J.‑F等人,Science 2013,341(6146),1238149)。Stoddart首次引入了“分子乐高(molecular LEGO)”的概念,其可以通过迭代的环稠合设计为具有所需的形状,例如带[n]芳烃和kohnkenes
(Hill,D.J.等人,Chemical Reviews 2001,101(12),3893‑4012)。更近期地,Bode团队展示了从单体砌块迭代组装多环饱和杂环化合物(Saito,F等人,Journal of the American 
Chemical Society 2019,141(13),5544‑5554)。
[0224] 螺环低聚物为由通过二酮哌嗪(DKP)环连接在一起的环状立体化学纯的双氨基酸砌块构成的稠环螺梯结构(Schafmeister,C.E.等人,Accounts of Chemical Research 
2008,41(10),1387‑1398)。螺环DKP的形成通过消除骨架中的单键旋转来增强骨架的刚性。
同时,骨架上的各种官能团的位置和取向由砌块的顺序和立体化学决定。正在开发螺环低
聚物的各种应用,包括作为有机反应的催化剂(Parker,M.F.L.等人,Journal of the 
American Chemical Society 2014,136(10),3817‑3827)、超分子金属结合络合物的模板
(Northrup,J.D.等人,Journal of Organic Chemistry 2021,86(6),4867‑4876)、蛋白质‑蛋白质相互作用的抑制剂(Brown,Z.Z等人,Plos One 2012,7(10))和碳水化合物结合分子
(Chepyshev,S.V.等人,Rocky Mountain Regional Meeting,Fort Collins,CO,United 
States 2020)。
[0225] 官能化螺环低聚物合成一直是困难的,这是因为,即使在~600mmol的规模下,单体合成也是耗时的。先前,原始的羧基苄基(Cbz)、叔丁氧基羰基(Boc)和对硝基苄氧基羰基(pNZ)已在固相合成中用作脯氨酸胺的链延伸可除去的保护基团。这些保护基团难以被除
去(例如Cbz)或者在脱保护期间导致副反应并且将树脂连接基团的选择限制为提供低收率
的那些(Cheong,J.E.,Tetrahedron Letters 2016,57(44),4882‑4884;Pfeiffer,C.T.等
人,Tetrahedron Letters 2018,59(30),2884‑2888)。
[0226] 芴基甲氧羰基(Fmoc)基团作为肽合成中优异的临时保护基团允许使用优异的高产可裂解树脂连接基团,例如氯‑三苯甲基连接基团(Behrendt,R.等人,Journal of 
Peptide Science 2016,22(1),4‑27;Ieronymaki,M.等人,Biopolymers 2015,104(5),
506‑514;Stathopoulos,P.等人,Journal of Peptide Science 2006,12(3),227‑232)。本文中描述的研究高效地将Fmoc基团引入螺环低聚物合成。该方法结合了数十公斤规模的双
氨基酸中间体的放大合成和高效的一锅合成方法来用Fmoc基团替代Cbz基团。使用Fmoc/
tBu固相合成来合成四种独特的螺环低聚物,并且通过核磁共振(NMR)光谱法来确认它们的
三维结构。
[0227] 为了显著地降低双氨基酸合成的人工成本和利用规模经济的优势,开发了对关键酮中间体2a和2b的大规模合成。与先前的合成(Cheong,J.E.,Tetrahedron Letters 2016,
57(44),4882‑4884)相比,目前利用的途径使中间体合成规模提高了三个数量级(图2)。放大合成消除了高毒性琼斯试剂的使用(Caron,S.等人,Chemical Reviews 2006,106(7),
2943‑2989),用避免在小规模时遇到的下游关于杂质的问题的、(2,2,6,6‑四甲基哌啶‑1‑基)氧基(TEMPO)介导的三氯异氰脲酸(TCCA)氧化来替代。
[0228] 放大合成还消除了在中试工厂规模下是一个问题的爆炸性异丁烯气体(Wright,S.W.等人,Tetrahedron Letters 1997,38(42),7345‑7348),并且利用叔丁基化试剂2,2,
2‑三氯乙酰亚胺叔丁酯(TBTA)来代替。在不到两个月的时间内,以比先前的合成更环保的方式、以低于每克4美元的成本生产了数十公斤立体化学纯的S‑和R‑对映异构体。
[0229] 按照之前开发的方案(Cheong,J.E.,Tetrahedron Letters 2016,57(44),4882‑4884),Bucherer‑Bergs反应将2a和2b各自转化为非对映异构的乙内酰脲的混合物,其中,对于2a,(2S,4S)立体异构体和(2S,4R)立体异构体各自的比例约为5:1。利用大规模快速色谱系统,使用二氯甲烷/异丙醇梯度来在一次负载中分离~200g粗品乙内酰脲非对映异构
体。使用溶剂回收系统来回收二氯甲烷。然后,如先前所报道,将各分离的立体化学纯的乙内酰脲产物水解以得到四种光学纯的双氨基酸(3a‑d)(Cheong,J.E.,Tetrahedron 
Letters 2016,57(44),4882‑4884)。以下描述详细的多公斤规模合成。
[0230] 由于Fmoc基团对碱敏感,因此砌块的Fmoc保护需要在水解乙内酰脲和除去Cbz基团之后进行。受到赖氨酸的选择性ω‑氨基保护的启发(Malkar,N.B等人,Letters in 
Peptide Science 2000,7(5),263‑267),开发了在脯氨酸氮上安装Fmoc基团的高效合成。
这依赖于临时封闭伯氨基的包含两个羧酸和两个α‑氨基的二聚Cu(II)络合物的形成。C2位的羧酸被叔丁基保护,这防止其与C1位的胺一起与铜形成络合物。因此,C4位的游离伯胺和
2+
羧酸通过与Cu 络合而被封闭。然后用Fmoc保护试剂例如Fmoc‑Cl或Fmoc‑OSu保护砌块中的脯氨酸氮。然后在交换的最后阶段通过强螯合剂使铜络合物解离。将该策略应用于四种双
氨基酸立体异构体(3a‑d;图3)。
[0231] 通过在Na2CO3水溶液中用Pd/C氢解来进行Cbz脱保护。在以下Cu(II)络合步骤中使用产物而不进行纯化。将半当量的CuCl2直接添加至悬浮液中以与双氨基酸的C4位的游离
胺和羧酸形成络合物,提供混合有Pd/C粉末的深蓝色溶液。在Schotten‑Baumann反应条件下,将轻微过量的在EtOAc中的Fmoc‑Cl滴加至水性浆料中。在使用短硅藻土塞将Pd/C滤出之前,将该双相混合物剧烈搅拌2小时。顶部的EtOAc层变为蓝色,具有比下方水相高得多的强度,表明形成了Fmoc保护的Cu络合物,其由于降低的极性而存在于有机相中。通过分液漏
2+
斗除去水相中的杂质。将收集的有机相与乙二胺四乙酸(EDTA)水溶液一起搅拌以除去Cu 。
[0232] 12小时后,蓝色完全从有机相转移至水相,表明Cu2+向后者的迁移。一旦Fmoc保护的双氨基酸砌块4a‑d从铜络合物中释放出来,它们就会从双相系统中沉淀出来以形成白色结晶粉末,如图25中所示。然后通过真空过滤分离纯的单保护固体产物4a‑d,而少量未反应的起始原料和杂质留在淡黄色EtOAc相中并且Cu‑EDTA副产物留在蓝色水相中。该四步过程不涉及色谱法。
[0233] 在固相组装之前,通过用相应的醛和温和的还原剂NaBH3CN处理砌块,使用还原性烷基化将各种官能团引入砌块。当可以在立体化学纯的砌块中安装选自大量醛的官能团以
形成可测量的量的用于螺环低聚物的固相合成的各单体时,这是螺环低聚物合成的有利特
征。将各Fmoc双氨基酸非对映异构体用不同官能团烷基化以获得官能化砌块5a‑d(图4)。
[0234] 选择四个侧链来表示宽范围的官能性,包括烷基、稠合芳香族基团、杂环基和芳基卤化物基团。对于Fmoc砌块的官能化和Pfp酯活化,发现先前用于pNZ、Boc和Cbz砌块的方法与新的Fmoc砌块相容(Pfeiffer,C.T.等人,Tetrahedron Letters 2018,59(30),2884‑2888;Brown,Z.Z等人,Biopolymers2011,96(5),578‑585)。
[0235] 通过以1:1的比例添加DCM和甲醇,将(2S,4R)‑和(2R,4S)‑非对映异构体溶解以提高还原性烷基化的效率。发现借助大量甲醇将粗品浆料固体负载至硅藻土上和在DCM中的0‑20%甲醇梯度下的正相色谱纯化官能化双氨基酸是高效的,收率范围为61%至90%。
[0236] 与先前的发现一致,各砌块的四元中心上的官能化仲胺受到空间位阻以使其无法以任何可察觉的速率与经活化的酯偶联(Brown,Z.Z.等人,Journal of the American 
Chemical Society 2008,130(44),14382‑14383)。因此,其可以用作固相合成的单体而无需保护5a‑d上的仲胺。
[0237] 先前观察到使用传统原位活化偶联策略的砌块的二聚化(Brown,Z.Z.等人,Journal of the American Chemical Society 2008,130(44),14382‑14383)。如图4中所
示,使用五氟苯酚(Pfp‑OH)来预活化单体并且获得实验室稳定的(bench‑stable)砌块6a‑d来使二聚化最小化(Pfeiffer,C.T.等人,Tetrahedron Letters 2018,59(30),2884‑
2888)。在偶联步骤中,可以将砌块的Pfp酯直接添加至固体载体上的胺以避免形成对称二
聚体。将各单体通过正相柱色谱以0‑50%己烷/EtOAc来纯化并且在‑20℃下储存直至需要。
[0238] 在半自动微波肽合成仪上用砌块6a‑d的四种立体异构体通过固相合成来组装高度官能化螺环低聚物。如图6中所示,首先使用N,N‑二异丙基乙胺(DIPEA)将L‑脯氨酸负载至2‑氯三苯甲基氯树脂上,然后是Fmoc基团的脱保护以产生7。使用针对pNZ砌块开发的类似的HOAt/DIPEA方案来偶联第二残余物Pfp酯6a(Pfeiffer,C.T.等人,Tetrahedron 
Letters 2018,59(30),2884‑2888)。
[0239] 优化后,发现在4当量HOAt和8当量DIPEA的存在下,2当量砌块足以在50℃下在1小时内完成偶联。使用过量的碱来平衡过量的HOAt的酸度,这过早地使极其敏感的氯‑三苯甲基连接基团裂解。在将砌块6b偶联至树脂上之后除去Fmoc以获得9。在下一个双氨基酸6c的偶联之后除去Fmoc基团以获得10。重复该方法用于最后一个砌块6d的安装,形成化合物11。
序列由Fmoc‑Dab(Boc)‑OH封端以提供12,通过暴露于TFA来使其从固相中释放。在将包含裂解产物12的TFA溶液在40℃下加热过夜之后,四聚体T1中的DKP完全形成,推测这是通过酸
催化缩合。在粗品HPLC中未观察到明显的副产物(图26)。基于树脂的最大负载,制备型HPLC后T1的最终收率为30%。
[0240] 为了证明该合成途径的通用性,通过改变砌块的位置来合成其它三种四聚体T2‑T4(图5)。T1‑T4的组成通过高分辨率质谱(QTOF MS)来验证(图27至图30)。二维NMR实验:进行在DMSO‑d6中的双量子滤波相关光谱(DQF‑COSY)、异核单量子相干光谱(HSQC)、异核多键
1 13
相关光谱(HMBC)和异核多量子相干(HMQC),并且用于用软件包SPARKY分配H和 C共振。预
期的连接性用谱带选择性HMBC谱图中来自相邻砌块之间相关性的交叉峰来确认。使用旋转
框架Overhauser效应光谱(ROESY)相关性来鉴定各吡咯烷中C2氢和C4氢的相对立体化学,
并且确认它们相对于各砌块上的C1碳的构型的构型。
[0241] 此外,所有侧链具有显示与骨架氢的ROESY相关性的氢,并且它们与具有优选取向的侧链一致。例如,如图6中所示,在第二双氨基酸脯氨酸环的平面下方的β质子之一FHB2与相邻砌块的侧基中的亚甲基质子之一GHa1(实心红色框)具有强的ROESY相关性。另一方面,在GHa1‑FHB1、GHa2‑FHB1或GHa2‑FHB2之间没有发现相关性(预期在绘制蓝色虚线圆圈的位置,图6)。这表明侧链的旋转受到与刚性骨架的相互作用限制,这满足对明确定义的3D结构的预期。T1的能量最小化结构也在图5中示出。
[0242] 总之,本研究展示了达到数十公斤规模的双氨基酸中间体的放大合成。Cu2+络合策略成功地用于在四步一锅法中选择性地引入Fmoc基团,无需色谱法,具有优异的收率和纯度。使用这些单体,用包含独特的官能团和立体化学的四种不同的砌块在固体载体上合成
四种螺环低聚物。该工作为高度官能化螺环低聚物库的可靠且自动的组装奠定了基础。
[0243] 总之,本研究描述了使用临时Cu2+络合策略的官能化双氨基酸砌块的芴基甲氧基羰基(Fmoc)保护以及双氨基酸前体的高效的多公斤规模合成。这允许利用固相Fmoc/tBu化
学合成在立体化学上和功能上多样的螺环低聚物以促进应用的开发。在半自动微波肽合成
仪上组装四种四聚体。还用二维核磁共振光谱确定了二级结构。
[0244] 现在描述本实验例中采用的材料和方法。
[0245] 一般过程
[0246] 反应在配备有涂覆有PTFE的磁力搅拌棒的标准和烘干玻璃器皿中进行。使用不锈钢注射器来转移对空气和水分敏感的液体。报告浓度是指室温下的溶液体积。在真空中的
蒸发和浓缩使用旋转蒸发器来进行。
[0247] 材料
[0248] 除非另有描述,否则试剂均从商业供应商处以试剂级购买并且使用而无需进一步纯化。合成了化合物S2a、S3a、2a、S2b、S3b和2b(Levins,C.G.等人,Journal of the 
1
American Chemical Society 2003,125(16),4702‑4703)。H NMR谱图非常干净并且与公
开的NMR谱图相比良好。按照先前报道的过程合成化合物3a‑d(Cheong,J.E.等人,
Tetrahedron Letters 2016,57(44),4882‑4884)。
[0249] 仪器
[0250] 低分辨率高效液相色谱‑质谱(LR‑HPLC‑MS)分析在Agilent 1290液相色谱系统上用Supelco  Express C8柱(2.7μm填料,2.1×50mm)使用包含0.1%甲酸的水‑乙腈梯度溶剂体系以1.0mL/min的流速进行。该系统连接至利用电喷雾离子化的Agilent 
6120单四极杆质谱仪。
[0251] 高分辨率HPLC‑MS在Agilent Infinity II系列LCMS系统上用Agilent Poroshell 120EC‑C18柱(1.9μm填料,2.1×50mm)使用包含0.1%甲酸的水‑乙腈梯度以1.0mL/min的流速进行。该系统连接至6000系列四极杆飞行时间(QTOF)质谱仪。
[0252] 制备型HPLC在Agilent Infinity II系列LC/MSD系统上用Phenomenex Aeris Peptide XB‑C18柱(5μm填料,21.2×150mm)使用包含0.1%三氟乙酸的水‑乙腈梯度溶剂体系以25mL/min的流速用利用电喷雾离子化的单四极杆质谱仪来进行。
[0253] 1H和13C一维核磁共振(NMR)实验在Bruker Avance 500MHz仪器上在25℃下进行。相对于残余溶剂峰或四甲基硅烷报告化学位移。数据如下来表示:化学位移、积分、多重性(br=宽、s=单重态、d=双重态、t=三重态、q=四重态、qn=五重态、sp=七重态、m=多重态),耦合常数以赫兹(Hz)计。由于叔酰胺导致一些化合物在室温下作为两种缓慢地相互转化的旋转异构体的混合物存在(在NMR时间标度上)。在NMR数据中标出了旋转异构体峰。
[0254] 二维NMR实验在Fox Chase癌症中心的光谱支持设施(SSF)的配备有冷冻探针的Bruker Avance NEO 600MHz光谱仪上进行。
[0255] 正相纯化在 (Teledyne,Inc.)自动快速色谱系统上使用购自SorbentTechnologies的各种尺寸的预填充 Rf硅胶柱( 孔隙率,230×400目
粒径)进行。
[0256] 乙内酰脲非对映异构体在 Isolera LS自动快速色谱系统上使用SNAP KP‑SIL 1500g柱( 孔隙率,50μm粒径)分离。
[0257] 反相纯化在ISCO(Teledyne,Inc.)自动快速色谱系统上使用购自SorbentTechnologies的各种尺寸的预填充 Rf C18反相柱( 孔隙率,230×
400目粒径)用包含0.1%甲酸的水‑乙腈梯度溶剂体系进行。
[0258] 螺环低聚物的固相合成在配备有25mL反应容器的来自CEM Corporation的DiscoverBio半自动微波辅助肽合成仪上进行。
[0259] 软件
[0260] 一维NMR谱图用Bruker Topspin处理。二维NMR谱图用SPARKY分析(Goddard,T.D.;Kneller,D.G.Sparky 3.190;University of California:SanFrancisco,CA,2015).(Lee,
W.等人,Bioinformatics 2014,31(8),1325‑1327)。
[0261] 分子图形用UCSF Chimera 1.14(版本(build)42094;Pettersen,E.F.等人,Journal of Computational Chemistry 2004,25(13),1605‑1612)来生成。
[0262] 使用内部软件包CANDO(github.com/cando‑developers/cando.git)来使用广义琥珀力场(GAFF)能量函数进行T1的三维结构的能量最小化(Wang,J.等人,Journal of 
Computational Chemistry 2004,25(9),1157‑1174)。
[0263] 缩写
[0264] DIPEA=二异丙基乙胺、DIC=N,N'‑二异丙基碳二亚胺、ESI=电喷雾离子化、HOAt=1‑羟基‑7‑氮杂苯并三唑、TFA=三氟乙酸、THF=四氢呋喃、DMF=二甲基甲酰胺、DMSO=二甲基亚砜、MTBE=甲基叔丁基醚、PyAOP=((7‑氮杂苯并三唑‑1‑基氧基)三吡咯烷基‑六氟磷酸盐)、Fmoc=芴基甲氧基羰基、Boc=叔丁氧基羰基、Cbz‑Cl=氯甲酸苄酯、Pfp=五氟苯基、EDTA=乙二胺四乙酸、Dab=2,4‑二氨基丁酸、pro=脯氨酸、NMR=核磁共振、TEMPO=(2,2,6,6‑四甲基哌啶‑1‑基)氧基或氧基自由基(oxidanyl)、TLC=薄层色谱法、DKP=二酮哌嗪、HPLC=高效液相色谱法、HR=高分辨率、LC=液相色谱法、LR=低分辨率、MS=质谱法。
[0265] 实验过程和表征数据
[0266] 砌块的合成和表征
[0267] 多公斤规模下2a的合成
[0268]
[0269] S2a的合成
[0270] (2S,4R)‑1‑((苄基氧基)羰基)‑4‑羟基吡咯烷‑2‑羧酸(S2a)‑纯化产率:27.7kg,91%。
[0271] 五个反应平行进行。向化合物1a(3.00kg,22.8mol)和NaHCO3(4.80kg,57.2mol)在H2O(18.0L)中的溶液中添加在THF(3L)中的CbzCl(3.71kg,21.7mol),并且将混合物在20℃下搅拌1h。TLC(石油醚/乙酸乙酯=3/1,Rf=0.00)显示CbzCl被完全消耗,TLC(二氯甲烷/甲醇=5/1,Rf=0.20)显示检测到产物。将五个反应合并用于继续处理。将反应混合物冷却至0℃,并且滴加HCl(12M,600.0mL,pH=2)。然后,将混合物用EtOAc(8.00L×2)萃取。将有机部分用盐水(5.00L)洗涤并且经Na2SO4干燥。将混合物在真空中浓缩以得到作为黄色油状1
物的化合物S2a。来自WuXi Apptec的 H NMR(400MHz,DMSO,观察到旋转异构体)δ7.29–7.38(m,5H),5.04–5.12(m,2H),4.21–4.30(m,2H),3.36–3.47(m,2H),2.12–2.20(m,1H),1.88–
1.98(m,1H)。
[0272] S3a的合成
[0273] (S)‑1‑((苄基氧基)羰基)‑4‑氧代吡咯烷‑2‑羧酸(S3a)‑纯化产率:15.0kg,92%。
[0274] 五个反应平行进行。在0℃下向化合物S2a(5.00kg,18.8mol)在EtOAc(25.0L)中的溶液中添加TEMPO(148.0g,942mmol)和三氯异氰脲酸(3.07kg,13.1mol)。将混合物在0℃下搅拌3h。TLC(二氯甲烷/甲醇=10/1,Rf=0.4)显示起始原料被完全消耗。将五个反应合并用于继续处理。将反应混合物过滤以除去不溶物。通过在0‑10℃下添加Na2S2O3(20.0L)来将混合物淬灭。将合并的有机层用盐水(10.0L×2)洗涤,并且经Na2SO4干燥、过滤并且减压浓缩以得到残余物。将粗制产物用石油醚/MTBE=1/1(10.0L)在25℃下研磨1h、过滤并且将溶
1
剂蒸发以提供作为白色固体的化合物S3a。来自WuXi Apptec的H NMR(400MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ9.05–9.09(m,1H),7.26–7.37(m,5H),5.16–5.27(m,2H),4.86–4.92(m,
1H),3.89–4.02(m,2H),2.94–3.06(m,1H),2.67–2.77(m,1H)。
[0275] 2a的合成
[0276] 1‑苄基‑2‑(叔丁基)(S)‑4‑氧代吡咯烷‑1,2‑二羧酸酯(2a)‑纯化产率:10.0kg,69%
[0277] 四个反应平行进行。在12℃下,向化合物S3a(3.00kg,11.4mol)在THF(12.0L)和环己烷(12.0L)中的溶液中添加2,2,2‑三氯乙酰亚胺叔丁酯(4.98kg,22.7mol)。在0℃下,向混合物中滴加二乙基氧鎓(三氟)硼酸铵(diethyloxonio(trifluoro)boranuide)(161.0g,1.14mol)。将混合物在12℃下搅拌2h。TLC(二氯甲烷/甲醇=10/1,Rf=0.8)显示起始原料被完全消耗。将四个反应合并用于继续处理。将混合物通过NaHCO3(4.00L)来淬灭,调节至pH=8,然后用盐水(5.00L)洗涤,并且经Na2SO4干燥。将有机层浓缩以得到残余物。将残余物过滤以除去不溶性物质,并且将溶液在真空中浓缩以得到作为棕色油状物的化合物2a。来
1
自WuXi Apptec的H NMR(400MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ7.32–7.38(m,5H),5.12–5.26(m,2H),4.68–4.76(m,1H),3.88–4.02(m,2H),2.90–3.00(m,1H),2.52–2.58(m,1H),1.41+
(s,9H,旋转异构)。HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+Na]C17H21NO5Na计算:342.1312;发现:342.1311。
[0278] 多公斤规模下2b的合成
[0279]
[0280] S2b的合成
[0281] (2R,4R)‑1‑((苄基氧基)羰基)‑4‑羟基吡咯烷‑2‑羧酸(S2b)‑纯化产率:15.0kg,82%。
[0282] 三个反应平行进行。向化合物1b(3.00kg,22.8mol)和NaHCO3(4.80kg,57.2mol)在H2O(18.0L)中的溶液中添加在THF(3.00L)中的CbzCl(3.71kg,21.7mol),并且将混合物在20℃下搅拌3h。TLC(石油醚/乙酸乙酯=3/1,Rf=0.00)显示CbzCl被完全消耗,TLC(二氯甲烷/甲醇=5/1,Rf=0.30)显示检测到产物。将三个反应合并用于后续处理。将反应混合物冷却至0℃,并且滴加HCl(12M,600mL,直至pH=2)。然后,将混合物用EtOAc(8.00L×2)萃取。将有机部分用盐水(5.00L)洗涤并且经Na2SO4干燥。将混合物在真空中浓缩以得到作为
1
白色固体的化合物S2b。来自WuXi Apptec的H NMR(400MHz,DMSO‑d6,观察到旋转异构体)δ
7.30–7.37(m,5H),5.02–5.08(m,2H),4.19–4.28(m,2H),3.55–3.59(m,1H),3.19–3.23(m,
1H),2.32–2.40(m,1H),1.89–1.93(m,1H)。
[0283] S3b的合成
[0284] (R)‑1‑((苄基氧基)羰基)‑4‑氧代吡咯烷‑2‑羧酸(S3b)‑纯化产率:12.0kg,94%
[0285] 三个反应平行进行。在0℃下,向化合物S2b(4.30kg,16.21mol)在DCM(28.0L)中的溶液中添加TEMPO(127.5g,810.5mmol)和三氯异氰脲酸(2.64kg,11.4mol)。将混合物在0℃下搅拌3h。TLC(二氯甲烷/甲醇=10/1,Rf=0.40)显示起始原料被完全消耗。将三个反应合并用于后续处理。将反应混合物过滤以除去不溶物。通过在0‑10℃下添加Na2S2O3(20.0L)来将混合物淬灭。将合并的有机层用盐水(10.0L×2)洗涤,并且经Na2SO4干燥、过滤并且减压浓缩以得到残余物。将粗制产物用石油醚/MTBE=1/1(10.0L)在25℃下研磨1h、过滤并且将1
溶剂蒸发以提供作为白色固体的化合物S3b。来自WuXi Apptec的H NMR(400MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ9.15(br,1H),7.32–7.35(m,5H),5.15–5.28(m,2H),4.84–4.90(m,1H),
3.88–4.00(m,2H),2.92–2.99(m,1H),2.70–2.74(m,1H)。
[0286] 2b的合成
[0287] 1‑苄基‑2‑(叔丁基)(R)‑4‑氧代吡咯烷‑1,2‑二羧酸酯(2b)‑纯化产率:13.0kg,89%
[0288] 四个反应平行进行。在12℃下,向化合物S3b(3.00kg,11.4mol)在THF(12.0L)和环己烷(12.0L)中的溶液中添加2,2,2‑三氯乙酰亚胺叔丁酯(4.98kg,22.7mol)。在0℃下,向混合物中滴加二乙基氧鎓(三氟)硼酸铵(161.0g,1.14mol)。将混合物在12℃下搅拌2h。TLC(二氯甲烷/甲醇=10/1,Rf=1.00)显示起始原料被完全消耗。TLC(石油醚/乙酸乙酯=3/1,Rf=0.5)显示检测到产物。将四个反应合并用于继续处理。将混合物通过NaHCO3(4.00L)来淬灭,调节至pH=8,然后用盐水(5.00L)洗涤,并且经Na2SO4干燥。将有机层浓缩以得到残余物。将残余物过滤以除去不溶物并且在真空中浓缩以得到作为棕色油状物的化合物2b。
1
来自WuXi Apptec的 H NMR(400MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ7.32–7.36(m,5H),5.13–
5.24(m,2H),4.69–4.75(m,1H),3.90–4.02(m,2H),2.90–2.98(m,1H),2.52–2.57(m,1H),+
1.40(s,9H,旋转异构)。HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+Na]C17H21NO5Na的计算值:342.1312;发现:
342.1312。
[0289] 化合物4a‑d的合成
[0290] (3S,5S)‑1‑(((9H‑芴‑9‑基)甲氧基)羰基)‑3‑氨基‑5‑(叔丁氧基羰基)吡咯烷‑3‑羧酸(4a)‑纯化产率,12.2g,71%
[0291] 将化合物3a‑d(38mmol)溶解于Na2CO3(300mL,0.2mol/L)中。向该溶液中添加Pd/C(10%wt),并且通过3通阀连接充满H2的气球。通过抽真空和回填H2数次来除去空气。在室温下搅拌过夜之后,达到反应完成(由LCMS监测)。向搅拌溶液中添加CuCl2(20mmol)并且反应30分钟。将溶解在EtOAc(100mL)中的Fmoc‑Cl(40mmol)滴加至反应混合物中并且再剧烈搅
拌2小时。使用硅藻土通过真空过滤除去Pd/C,并且收集有机层、用饱和NaCl溶液(250mL×
2)洗涤并且转移至烧杯中。然后将溶液与EDTA钠盐溶液(250mL,0.2M)混合,剧烈搅拌过夜。
1
在真空过滤下分离产物4a‑d,为白色固体。进行该四步反应顺序而无需任何色谱法。H NMR(500MHz,DMSO)δ8.78(s,2H),7.91(t,J=7.4Hz,2H),7.64(d,J=7.5Hz,2H,旋转异构),
7.43(t,J=7.3Hz,2H),7.34–7.31(m,2H),4.42–4.15(m,4H,旋转异构),4.04(d,J=
11.5Hz,1H,旋转异构),3.58(d,J=11.5Hz,1H,旋转异构),2.88(dd,J=13.4,8.5Hz,1H,旋
13
转异构),2.21(dd,J=13.4,8.8Hz,1H,旋转异构),1.40(s,9H)。C NMR(125MHz DMSO,观察到旋转异构体)δ172.1,171.7,170.8,170.7,154.1,154.0,144.2,144.1,144.0,143.7,
141.2,128.3,128.2,127.6,125.9,125.7,125.6,120.6,81.9,81.5,67.7,67.3,62.0,
61.0,60.2,59.9,55.1,54.3,47.1,46.9,38.9,37.9,28.1,28.00;HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+
+
H]C25H29N2O6的计算值:453.2020;发现:453.2016。
[0292] (3R,5S)‑1‑(((9H‑芴‑9‑基)甲氧基)羰基)‑3‑氨基‑5‑(叔丁氧基羰基)吡咯烷‑3‑羧酸(4b)‑纯化产率,13.0g,74%。
[0293] 1H NMR(500MHz,DMSO)δ8.74(s,2H),7.91(d,J=7.5Hz,2H),7.72–7.66(m,2H),7.44(t,J=7.4Hz,2H),7.36–7.31(m,2H),4.61,4.41(m,1H,旋转异构),4.40–4.04(m,2H,旋转异构),3.99(m,1H,旋转异构),3.85,3.76(d,J=12.2Hz,1H,旋转异构),2.77,2.67
(dd,J=14.1,9.0Hz,1H,旋转异构),2.50(dd,J=14.3,7.8Hz,1H,旋转异构),1.40(d,J=
13
5.3Hz,9H);C NMR(125MHz,DMSO,观察到旋转异构体)δ170.9,170.3,169.9,163.6,154.0,
153.8,144.1,144.0,143.7,141.2,141.1,128.3,128.2,127.7,127.6,125.9,125.8,
125.7,120.7,120.6,82.2,81.8,68.0,67.7,63.9,63.0,58.9,58.4,55.0,54.4,47.0,
+
46.9,38.1,28.0;HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H] C25H29N2O6的计算值:453.2020,发现:
453.2028。
[0294] (3R,5R)‑1‑(((9H‑芴‑9‑基)甲氧基)羰基)‑3‑氨基‑5‑(叔丁氧基羰基)吡咯烷‑3‑羧酸(4c)‑纯化产率,10.9g,64%。
[0295] 1H NMR(500MHz,DMSO)δ8.78(s,2H),7.91(t,J=7.4Hz,2H),7.64(d,J=7.5Hz,2H,旋转异构),7.43(t,J=7.3Hz,2H),7.34–7.31(m,2H),4.42–4.15(m,4H,旋转异构),
4.04(d,J=11.4Hz,1H,旋转异构),3.58(d,J=11.5Hz,1H,旋转异构),2.88,2.84(dd,J=
13
13.3,8.5Hz,1H,旋转异构),2.24,2.21(dd,J=13.3,8.8Hz,1H,旋转异构),1.41(s,9H);C NMR(125MHz,DMSO,观察到旋转异构体)δ172.1,171.7,170.9,170.8,154.1,154.0,144.2,
144.1,144.0,143.7,141.1,128.3,128.2,127.6,125.9,125.7,125.6,121.9,120.6,
120.5,81.9,81.5,67.7,67.3,62.0,61.0,60.2,59.9,55.1,54.3,47.1,46.9,38.9,37.9,
+
28.1,28.0;HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H]C25H29N2O6的计算值:453.2020,发现:453.2017。
[0296] (3R,5S)‑1‑(((9H‑芴‑9‑基)甲氧基)羰基)‑3‑氨基‑5‑(叔丁氧基羰基)吡咯烷‑3‑羧酸(4d)‑纯化产率,14.7g,85%。
[0297] 1H NMR(500MHz,DMSO)δ8.75(s,2H),7.91(d,J=7.6Hz,2H),7.72–7.66(m,2H),7.44(t,J=7.5Hz,2H),7.36–7.31(m,2H),4.61,4.41(m,1H,旋转异构),4.40–4.04(m,2H,旋转异构),3.99(m,1H,旋转异构),3.85,3.78(d,J=12.2Hz,1H,旋转异构),2.77,2.67
(dd,J=14.1,7.7Hz,1H,旋转异构),2.53,2.45(dd,J=14.3,7.6Hz,1H,旋转异构),1.40
13
(d,J=5.3Hz,9H);C NMR(125MHz,DMSO,观察到旋转异构体)δ170.8,170.3,169.9,163.6,
154.0,153.8,144.1,143.7,141.2,141.1,128.4,128.2,127.7,127.6,125.9,125.8,
125.7,120.7,82.2,81.8,68.0,67.7,63.8,62.9,58.8,58.4,54.9,54.6,47.0,38.1,28.0;
+
HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H]C25H29N2O6的计算值:453.2020,发现:453.2029。
[0298] 化合物5a‑d的合成
[0299]
[0300] 官能化双氨基酸5a的合成
[0301] (3S,5S)‑1‑(((9H‑芴‑9‑基)甲氧基)羰基)‑5‑(叔丁氧基羰基)‑3‑((萘‑2‑基甲基)氨基)吡咯烷‑3‑羧酸(5a)‑纯化产率,1.82g,61%。
[0302] 将2‑萘甲醛(7.5mmol)添加至包含溶解于25mL MeOH中的化合物4a(5mmol)的100mL圆底烧瓶中。将溶液搅拌30min,同时添加NaBH3CN(7.5mmol)并且使其搅拌过夜。反应进程通过LCMS来确定,并且,如果不完全,则添加额外的醛和还原剂。当还原性烷基化完成时,将溶液转移至包含10g硅藻土的圆底烧瓶。将溶剂在减压下除去,然后将干燥粉末转移至负载柱中用于快速色谱。正相分离用DCM/在DCM中的20% MeOH的流动相使用0‑100%梯
度来进行。收集包含纯产物的级分并且将溶剂在减压下除去,以得到官能化双氨基酸5a。通
1
过LCMS来检查纯度。H NMR(500MHz,DMSO)δ7.90–7.83(m,6H),7.68–7.63(m,2H),7.53–
7.38(m,5H),7.34–7.28(m,2H),4.39,4.32(m,1H,旋转异构),4.23(m,2H,旋转异构),4.15(m,1H,旋转异构),4.00,3.90(m,1H,旋转异构),3.88(m,1H),3.82(m,1H),3.52,3.46(d,J
=10.8Hz,1H,旋转异构),2.76–2.68(m,1H,旋转异构),2.15,2.07(dd,J=12.8,6.0Hz,1H,
13
旋转异构),1.36(s,9H);C NMR(125MHz,DMSO)δ174.4,171.2,170.8,154.3,144.3,144.1,
143.9,141.1,137.2,133.3,132.7,128.2,128.0,127.6,127.4,127.0,126.5,126.1,
125.8,125.7,125.6,120.6,81.3,81.0,68.2,67.5,67.3,59.7,59.3,54.9,54.4,49.0,
+
47.2,46.9,39.1,38.0,28.1;HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H]C36H37N2O6的计算值:593.2624,发现:593.2638。
[0303] 官能化双氨基酸5b的合成
[0304] (3R,5S)‑1‑(((9H‑芴‑9‑基)甲氧基)羰基)‑5‑(叔丁氧基羰基)‑3‑(异戊基氨基)吡咯烷‑3‑羧酸(5b)‑纯化产率,2.34g,90%。
[0305] 将异戊醛(7.5mmol)添加至包含悬浮在25mL MeOH/DCM中的化合物4b(5mmol)的100mL圆底烧瓶中。将溶液搅拌30min,同时添加NaBH3CN(7.5mmol)并且搅拌过夜。反应进程通过LCMS来确定,并且,如果不完全,则添加额外的醛和还原剂。当还原性烷基化完成时,将溶液转移至包含10g硅藻土的圆底烧瓶。将溶剂在减压下除去,然后将干燥粉末转移至负载柱中用于快速色谱。正相分离用DCM/在DCM中的20% MeOH的流动相使用0‑100%梯度来进
行。收集包含纯产物的级分并且将溶剂在减压下除去,以得到官能化双氨基酸5b。通过LCMS
1
来检查纯度。H NMR(500MHz,DMSO)δ7.91–7.89(m,2H),7.68–7.64(m,2H),7.44–7.41(m,
2H),7.35–7.30(m,2H),4.55,4.49(dd,J=9.1,5.6Hz,1H,旋转异构),4.47–4.45(m,1H),
4.27,4.23(m,1H,旋转异构),4.15(m,1H,旋转异构),4.05(t,J=13.6Hz,1H),3.84(d,J=
12.7Hz,1H,旋转异构),3.07–2.83(m,3H),2.63,2.55(dd,J=14.8,5.4Hz,1H,旋转异构),
13
1.67–1.61(m,1H),1.53–1.49(m,2H),1.40(s,9H,旋转异构),0.89(d,J=6.6Hz,6H);C 
NMR(125MHz,DMSO)δ170.2,169.9,169.4,169.3,153.8,153.7,144.1,143.7,141.2,128.3,
127.6,125.7,125.5,120.6,119.2,116.9,114.6,112.3,82.3,81.9,69.0,68.1,67.9,
58.9,58.5,53.5,52.9,47.0,46.9,43.0,36.6,35.3,27.9,25.7,22.3;HRMS(ESI‑TOF)m/z:
+
[M+H]C30H39N2O6的计算值:523.2803,发现:523.2797。
[0306] 官能化双氨基酸5c的合成
[0307] (3R,5R)‑1‑(((9H‑芴‑9‑基)甲氧基)羰基)‑5‑(叔丁氧基羰基)‑3‑((吡啶‑4‑基甲基)氨基)吡咯烷‑3‑羧酸(5c)‑纯化产率,2.16g,79%。
[0308] 将4‑吡啶甲醛(7.5mmol)添加至包含溶解于25mL MeOH中的化合物4c(5mmol)的100mL圆底烧瓶中。将溶液搅拌30min,同时添加NaBH3CN(7.5mmol)并且使其静置过夜。反应进程通过LCMS来确定,并且,如果不完全,则添加额外的醛和还原剂。当还原性烷基化完成时,将溶液转移至包含10g硅藻土的圆底烧瓶。将溶剂在减压下除去,然后将干燥粉末转移至负载柱中用于快速色谱。正相分离用DCM/在DCM中的20% MeOH的流动相使用0‑100%梯
度来进行。收集包含纯产物的级分并且将溶剂在减压下除去,以得到官能化双氨基酸5c。通
1
过LCMS来检查纯度。H NMR(500MHz,DMSO)δ8.46–8.43(m,2H),7.89(d,J=7.6Hz,2H),
7.69–7.64(m,2H),7.43–7.39(m,2H),7.36–7.30(m,4H),4.37–4.04(m,4H),3.96,3.85(d,J=10.2Hz,1H,旋转异构),3.63(q,J=13.9Hz,2H),3.32,3.24(d,J=10.2Hz,1H,旋转异
构),2.64–2.55(m,1H,旋转异构),1.93,1.86(dd,J=12.3,5.9Hz,1H,旋转异构),1.35(s,
13
9H,旋转异构);C NMR(125MHz,DMSO)δ176.3,171.7,171.3,154.4,154.3,151.1,149.6,
144.5,144.2,143.9,141.1,128.2,127.6,125.8,125.7,125.6,123.4,120.6,80.8,80.5,
69.0,68.0,67.3,67.1,60.0,59.7,55.8,55.2,48.1,47.2,47.0,39.1,28.1;HRMS(ESI‑
+
TOF)m/z:[M+H]C31H34N3O6的计算值:544.2442,发现:544.2445。
[0309] 官能化双氨基酸5d的合成
[0310] (3S,5R)‑1‑(((9H‑芴‑9‑基)甲氧基)羰基)‑5‑(叔丁氧基羰基)‑3‑((3,4‑二氯苄基)氨基)吡咯烷‑3‑羧酸(5d)‑纯化产率,2.67g,87%。
[0311] 将3,4‑二氯苯甲醛(7.5mmol)添加至包含悬浮在25mL MeOH中的化合物4d(5mmol)的100mL圆底烧瓶中。将溶液搅拌30min,同时添加NaBH3CN(7.5mmol)并且使其静置过夜。反应进程通过LCMS来确定,并且,如果不完全,则添加额外的醛和还原剂。当还原性烷基化完成时,将溶液转移至包含10g硅藻土的圆底烧瓶。将溶剂在减压下除去,然后将干燥粉末转移至负载柱中用于快速色谱。正相分离用DCM/在DCM中的20% MeOH的流动相使用0‑100%
梯度来进行。收集包含纯产物的级分并且将溶剂在减压下除去,以得到官能化双氨基酸5d。
1
通过LCMS来检查纯度。H NMR(500MHz,DMSO)δ7.91–7.86(m,2H),7.68(d,J=7.5Hz,1H,旋转异构),7.59–7.49(m,3H),7.43–7.22(m,5H),4.36–4.27(m,1H,旋转异构),4.22–4.11,
4.04(m,3H,旋转异构),3.73–3.45(m,4H),2.34,2.10(m,1H,旋转异构),2.21(dd,J=12.8,
13
8.5Hz,1H,旋转异构),1.38(s,9H,旋转异构);C NMR(125MHz,DMSO)δ174.8,174.7,172.1,
171.6,154.5,154.4,144.3,144.1,143.7,141.1,131.2,131.1,130.6,130.5,130.1,
130.0,129.4,129.3,128.5,128.3,128.1,127.6,127.5,125.8,125.6,125.5,125.4,
120.7,120.6,81.3,80.9,69.4,68.6,67.5,67.0,59.9,59.4,55.2,54.2,47.2,47.1,46.9,
+
38.9,28.1,28.0;HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H] C32H33Cl2N2O6的计算值:611.1710,发现:
611.1714。
[0312] 化合物6a‑d的合成
[0313]
[0314] 官能化五氟苯酯6a的合成
[0315] 1‑((9H‑芴‑9‑基)甲基)2‑(叔丁基)4‑(全氟苯基)(2S,4S)‑4‑((萘‑2‑基甲基)氨基)吡咯烷‑1,2,4‑三羧酸酯(6a)‑纯化产率,1.07g,71%。
[0316] 称量化合物5a(2mmol)和五氟苯酚(10mmol)并且将其溶解于10mL DCM中。添加DIC(4mmol),并且使反应搅拌过夜。反应的完成通过LCMS来检查,然后将反应转移至包含硅藻土(5g)的50mL圆底烧瓶中。在室温下,通过在减压下除去溶剂来获得白色粉末。用干燥硅藻土装柱,从而使用己烷/EtOAc、使用5‑100% EtOAc梯度运行快速色谱。在减压下收集包含
1
纯产物的级分以得到作为淡黄色固体的6a。H NMR(500MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ
7.83–7.74(m,6H),7.64–7.57(m,2H),7.51–7.46(m,3H),7.42–7.36(m,2H),7.32–7.25(m,
2H),4.56–4.46(m,2H),4.38–4.21(m,3H),4.00–3.84(m,3H),2.94(m,1H),2.50(dt,J=
13
12.9,4.7Hz,1H,旋转异构),1.43(s,9H,旋转异构);C NMR(125MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ170.2,170.1,169.7,169.6,154.4,144.2,144.0,143.7,143.5,141.3,141.2,
136.0,135.9,133.4,132.9,128.3,127.8,127.7,127.1,127.0,126.9,126.6,126.5,
126.2,125.9,125.3,125.2,125.1,125.0,120.0,82.2,82.1,68.8,68.0,67.9,58.9,58.7,
54.6,54.2,49.7,49.0,47.3,47.1,39.5,38.3,28.1,28.0,24.6;HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H
+
]C42H36F5N2O6的计算值:759.2423,发现:759.2488。
[0317] 官能化五氟苯酯6b的合成
[0318] 1‑((9H‑芴‑9‑基)甲基)2‑(叔丁基)4‑(全氟苯基)(2S,4R)‑4‑(异戊基氨基)吡咯烷‑1,2,4‑三羧酸酯(6b)‑纯化产率,1.01g,73%。
[0319] 称量化合物5b(2mmol)和五氟苯酚(10mmol)并且将其溶解于10mL DCM中。添加DIC(4mmol)并且使反应搅拌过夜。反应的完成通过LCMS来检查,然后将反应转移至包含硅藻土(5g)的50mL圆底烧瓶中。在室温下,通过在减压下除去溶剂来获得白色粉末。用干燥硅藻土装柱,从而使用己烷/EtOAc、使用5‑100% EtOAc梯度运行快速色谱。在减压下收集包含纯
1
产物的级分以得到作为白色固体的6b(50.7%)。H NMR(500MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ7.78–7.76(m,2H),7.69–7.59(m,2H),7.43–7.39(m,2H),7.34–7.30(m,2H),4.55–4.20(m,
4H),4.05(t,J=13.6Hz,1H),4.02,3.84(m,1H,旋转异构),2.63–2.43(m,4H),1.46(s,9H,
13
旋转异构);1.41(q,J=7.2Hz,2H),1.22(d,J=6.4Hz,1H),0.92–0.89(m,6H);C NMR
(125MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ171.0,170.7,168.8,168.7,154.7,144.2,144.0,
143.8,143.5,141.4,141.3,127.8,127.7,127.2,127.1,125.5,125.2,125.1,120.0,82.2,
82.0,68.2,68.1,67.7,67.4,59.2,58.9,54.6,54.1,47.2,47.1,42.7,42.7,39.4,39.4,
+
38.9,37.8,28.0,26.0,25.9,22.6,22.5;HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H]C36H38F5N2O6的计算值:
689.2645,发现:689.2649。
[0320] 官能化五氟苯酯6c的合成
[0321] 1‑((9H‑芴‑9‑基)甲基)2‑(叔丁基)4‑(全氟苯基)(2R,4R)‑4‑((吡啶‑4‑基甲基)氨基)吡咯烷‑1,2,4‑三羧酸酯(6c)‑纯化产率,0.752g,53%。
[0322] 称量化合物5c(2mmol)和五氟苯酚(10mmol)并且将其溶解于10mL DCM中。添加DIC(4mmol),并且使反应搅拌过夜。反应的完成通过LCMS来检查,然后将反应转移至包含硅藻土(5g)的50mL圆底烧瓶中。在室温下,通过在减压下除去溶剂来获得白色粉末。用干燥硅藻土装柱,从而使用己烷/EtOAc、使用5‑100% EtOAc梯度运行快速色谱。在减压下收集包含
1
纯产物的级分以得到作为白色固体的6c。H NMR(500MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ8.58–
8.45(m,2H),7.78–7.75(m,2H),7.64–7.56(m,2H),7.42–7.37(m,4H),7.32–7.25(m,2H),
4.55–4.47(m,2H),4.41–4.33(m,1H),4.29–4.10(m,2H),3.89–3.74(m,3H),2.96–2.86(m,
13
1H,旋转异构),2.47(td,J=13.8,3.9Hz,1H),1.44(d,9H,旋转异构);C NMR(125MHz,
CDCl3,观察到旋转异构体)δ175.6,175.5,171.1,171.0,170.2,169.2,169.1,154.4,
149.5,149.4,148.5,148.4,147.6,144.1,143.9,143.6,143.4,141.3,127.8,127.2,
127.1,127.0,125.2,125.1,125.0,123.6,123.5,120.0,82.5,82.4,68.7,67.7,58.8,
+
58.6,54.4,54.0,48.1,47.3,47.1,39.5,38.2,28.1;HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H]C37H33F5N3O6的计算值:710.2284,发现:710.2289。
[0323] 官能化五氟苯酯6d的合成
[0324] 1‑((9H‑芴‑9‑基)甲基)2‑(叔丁基)4‑(全氟苯基)(2R,4S)‑4‑((3,4‑二氯苄基)氨基)吡咯烷‑1,2,4‑三羧酸酯(6d)‑纯化产率,1.10g,71%。
[0325] 称量化合物5d(2mmol)和五氟苯酚(10mmol)并且将其溶解于10mL DCM中。添加DIC(4mmol),并且使反应搅拌过夜。反应的完成通过LCMS来检查,然后将反应转移至包含硅藻土(5g)的50mL圆底烧瓶中。在室温下,通过在减压下除去溶剂来获得白色粉末。用干燥硅藻土装柱,从而使用己烷/EtOAc、使用5‑100% EtOAc梯度运行快速色谱。在减压下收集包含
1
纯产物的级分以得到作为白色固体的6d。H NMR(500MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ7.78–
7.51(m,4H),7.45–7.14(m,7H),4.58–4.45(m,2H,旋转异构),4.39–4.30(m,1H,旋转异构),
4.22(t,J=7.1Hz,1H),4.10–4.02(m,1H),3.97–3.64(m,3H),2.63–2.46(m,2H),1.46(s,
13
9H,旋转异构);C NMR(125MHz,CDCl3,观察到旋转异构体)δ170.7,170.5,168.4,168.3,
154.8,154.6,144.1,143.9,143.7,143.4,141.3,141.3,139.2,139.1,132.7,131.6,
130.5,129.9,129.8,127.8,127.2,127.1,125.4,125.1,125.0,124.9,120.1,120.0,
119.9,82.5,82.3,68.2,67.5,59.1,58.9,54.3,53.6,47.7,47.6,47.2,47.1,39.3,38.2,
+
28.0;HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H]C38H32Cl2F5N2O6的计算值:777.1481,发现:777.1556。
[0326] 螺环低聚物的固相合成
[0327] 固相合成的一般过程
[0328] 树脂负载的一般过程
[0329] 螺环低聚物的固相合成在微波肽合成仪上进行。将Cl‑TCP(Cl)Protide树脂(100mg,0.05mmol,0.5mmol/g负载)称量至25mL反应容器中。将Fmoc‑Pro‑OH称量至2mL离心管中并且用DIPEA(168μL,1mmol)溶解在无水DMF(2mL)中。然后将该溶液一次性添加至反应容器中的树脂中,并且使其在Ar鼓泡下在50℃反应30min。在将溶液排干之后,将树脂用2mL DMF洗涤三次。用包含1:3:17的甲醇/DIPEA/DCM的2mL封端溶液将未反应的三苯甲基氯在室
温下封端10min,并且将树脂用DMF洗涤三次。
[0330] Fmoc脱保护的一般过程
[0331] 所有脱保护均用在DMF(2mL)中的20%哌啶完成(1×4min,60℃)。在每次Fmoc脱保护之后,将树脂用DMF(3×1mL)洗涤。
[0332] 砌块的偶联的一般过程
[0333] 将砌块(0.1mmol,2当量)在1mL无水DMF中的溶液添加至反应容器中的树脂中。然后,添加HOAt(27.2mg,0.2mmol)和DIPEA(69.7μL,0.4mmol)在1mL无水DMF中的溶液。将反应混合物在50℃加热1小时。反应的完成通过在用DMF洗涤之后用LCMS测试裂解来确认。
[0334] Fmoc‑Dab(Boc)‑OH的偶联的一般过程
[0335] 将在1mL DMF中的Fmoc‑Dab(Boc)‑OH(63.9mg,0.15mmol,3当量)与PyAOP(78.2mg,0.15mmol)、DIPEA(52.3mL,0.3mmol)和DMF(2mL)的混合物一起转移至反应器中,并且将它们静置以在50℃反应5min。反应的完成通过在用DMF洗涤之后用LCMS测试裂解来确认。
[0336] 裂解和DKP闭合的一般过程
[0337] 最终裂解通过在室温下使用TFA(2mL×2)30min来实现。将产物收集至50mL离心管中并且转移至20mL玻璃小瓶。将其置于加热块中,在40℃搅拌过夜。
[0338] T1的固相合成
[0339] 将第一残余物Fmoc‑Pro‑OH(169mg,0.5mmol)用树脂负载的一般过程负载至树脂(100mg,0.05mmol,0.5mmol/g负载)上并且用Fmoc脱保护的一般过程脱保护。砌块的偶联和Fmoc脱保护的一般过程采用6a(75.8mg,0.1mmol,2当量)、然后是6b(68.8mg,0.1mmol)、6c(71mg,0.1mmol)和6d(77.3mg,0.1mmol)来进行。然后,如上所述将Fmoc‑Dab(Boc)‑OH
(63.9mg,0.15mmol)偶联并且脱保护。最后,T1的裂解和DKP闭合按照一般过程来进行。在通过LCMS确认DKP闭合的完成之后,使产物在冷乙醚中沉淀并且通过制备型HPLC(在具有
0.1% TFA的水中的25%‑95%梯度的MeCN)来纯化。收集包含产物的纯化级分,然后冻干以得到作为白色粉末的螺环低聚物T1。T1‑纯化产率,18mg,30%;HPLC纯度,98%;保留时间,+
3.122min。HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H]C62H67Cl2N12O10的计算值:1209.44,发现:1209.44。
[0340] T2的固相合成
[0341] 将第一残余物Fmoc‑Pro‑OH(169mg,0.5mmol)用树脂负载的一般过程负载至树脂(100mg,0.05mmol,0.5mmol/g负载)上并且用Fmoc脱保护的一般过程脱保护。砌块的偶联和Fmoc脱保护的一般过程采用6d(77.3mg,0.1mmol,2当量)、然后是6c(71mg,0.1mmol)、6b(68.8mg,0.1mmol)和6a(75.8mg,0.1mmol)来进行。然后,如上所述将Fmoc‑Dab(Boc)‑OH(63.9mg,0.15mmol)偶联并且脱保护。最后,T2的裂解和DKP闭合按照一般过程来进行。在通过LCMS确认DKP闭合的完成之后,使产物在冷乙醚中沉淀并且通过制备型HPLC(在具有
0.1% TFA的水中的25%‑95%梯度的MeCN)来纯化。收集包含产物的纯化级分,然后冻干以得到作为白色粉末的螺环低聚物T2。T2‑纯化产率,16mg,27%;HPLC纯度,96%;保留时间,+
3.297min。HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H]C62H66Cl2N12O10的计算值:1209.44,发现:1209.45。
[0342] T3的固相合成
[0343] 将第一残余物Fmoc‑Pro‑OH(169mg,0.5mmol)用树脂负载的一般过程负载至树脂(100mg,0.05mmol,0.5mmol/g负载)上并且用Fmoc脱保护的一般过程脱保护。砌块的偶联和Fmoc脱保护的一般过程采用6b(68.8mg,0.1mmol,2当量)、然后是6d(77.3mg,0.1mmol)、6a(75.8mg,0.1mmol)和6c(71mg,0.1mmol)来进行。然后,如上所述将Fmoc‑Dab(Boc)‑OH
(63.9mg,0.15mmol)偶联并且脱保护。最后,T3的裂解和DKP闭合按照一般过程来进行。在通过LCMS确认DKP闭合的完成之后,使产物在冷乙醚中沉淀并且通过制备型HPLC(在具有
0.1% TFA的水中的25%‑95%梯度的MeCN)来纯化。收集包含产物的纯化级分,然后冻干以得到作为白色粉末的螺环低聚物T3。T3‑纯化产率,15mg,24%;HPLC纯度,>99%;保留时间,+
3.515min。HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H]C62H67Cl2N12O10的计算值:1209.44,发现:1209.45。
[0344] T4的固相合成
[0345] 将第一残余物Fmoc‑Pro‑OH(169mg,0.5mmol)用树脂负载的一般过程负载至树脂(100mg,0.05mmol,0.5mmol/g负载)上并且用Fmoc脱保护的一般过程脱保护。砌块的偶联和Fmoc脱保护的一般过程采用6c(71mg,0.1mmol,2当量)、然后是6d(77.3mg,0.1mmol)、6a(75.8mg,0.1mmol)和6b(68.8mg,0.1mmol)来进行。然后,如上所述将Fmoc‑Dab(Boc)‑OH(63.9mg,0.15mmol)偶联并且脱保护。最后,T4的裂解和DKP闭合按照一般过程来进行。在通过LCMS确认DKP闭合的完成之后,使产物在冷乙醚中沉淀并且通过制备型HPLC(在具有
0.1% TFA的水中的25%‑95%梯度的MeCN)来纯化。收集包含产物的纯化级分,然后冻干以得到作为白色粉末的螺环低聚物T4。T4‑纯化产率,19mg,32%;HPLC纯度,>99%;保留时间,+
3.333min。HRMS(ESI‑TOF)m/z:[M+H] C62H67Cl2N12O10的计算值:1209.44,发现:1209.45。
(2S,4R)‑1‑((苄基氧基)羰基)‑4‑羟基吡咯烷‑2‑羧酸(S2a)。
[0346] 本文中引用的每一项专利、专利申请和出版物的公开内容以其整体通过引用在此并入本文。虽然已经参考具体实施方案公开了本发明,但是,显而易见,在不偏离本发明的真正精神和范围的情况下,本领域其它技术人员可以设计出本发明的其它实施方案和变
形。所附权利要求旨在被解释为包括所有此类实施方案以及等同的变形。

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