本发明公开了一种中药制药生产工序的多系统协同反馈调控方法及系统，方法包括：SCADA系统获取目标生产工艺设备的实时生产数据，近红外光谱仪获取质量检测对象的在线光谱数据；分析系统根据实时生产数据和在线光谱数据，基于Unscrambler Process Pulse平台挖掘PCA模型工艺数据的关键特征变量，用于构建工艺终点确定模型，以输出控制指标参数Hotelling’S T2值；SCADA系统采集控制指标参数Hotelling’S T2值，并监控其小于或等于预设终点阈值的时机以下发针对预设的关键生产工艺设备质量控制项预先设定的终点控制值至目标生产工艺设备，实现对生产工序质量的自动闭环控制。