本发明公开了一种基于运行指标的医院经济运行数据分析方法，该方法包括以下步骤：根据预设的指标需求，多维度筛选医院运行指标；收集目标医院的历史运营数据，计算各医院运行指标的变化率；分析医院运行指标与历史运营数据之间的第一关联系数及医院运行指标与各医院运行指标的变化率之间的第二关联系数；预测各医院运行指标的未来趋势，计算指数波动因子；基于目标医院的运营指标数据和预期业务规模，计算指数趋势因子；估算目标医院的经济运行指数。本发明通过结合目标医院的运营指标数据和预期业务规模，具有更强的针对性和实际意义，同时利用灰色关联度分析方法能够发现数据中的潜在关联，提高数据分析和预测的准确性。