本发明公开了基于荧光检测系统的复合光纤及其制备方法，涉及复合光纤材料技术领域，该复合光纤，包括：纤芯棒，其材料组份包括半导体硒粉；纤芯层，其材料包括胺菊酯改性聚甲基丙烯酸甲酯。制备方法具体为：纤芯棒的制备，采用熔融浇筑法制备而得；复合光纤的制备，取改性聚甲基丙烯酸甲酯棒料，按尺寸要求对棒进行磨抛；然后在棒内加工一个圆柱孔，选取合适尺寸的纤芯棒，填充到上述改性聚甲基丙烯酸甲酯棒管中得到复合预制棒；接着170~180℃下真空固结1~1.5h，放置到标准拉斯塔上拉制得复合光纤。本发明制得的复合光纤机械性能优异，耐热性能好、吸水率低；具有良好的光学透过性，且损耗低，适用范围提升。