[0001] 本发明涉及生物技术领域，更具体的说是涉及YEL013W基因和YER042W基因的应用。

[0002] 近年来，随着基因组测序的能力不断提升，已经能够解析出过去难以发现的普遍存在的基因组重排现象。20世纪研究发现的基因组变异主要形式是单核苷酸多态性(SNP)和异染色质多态性(HP)。然而，近几年研究发现，在微生物(如耶尔森氏菌、酵母)、植物(如青草、水稻)、动物(如七鳃鳗、小鼠)、人类基因组中普遍发现了基因组重排现象，尤其是，基因组内大量结构变异(SV)(包括片段缺失、重复、水平迁移、相互易位、倒位等)是包含更多信息变化的更高频遗传变异方式，这为基因组通过重排推动生命进化提供了关键性证据。天然基因组重排与性状改变之间存在普遍联系，为我们研究生命进化与新功能产生提供了重要蓝本。

[0003] 天然基因组重排和变异时间跨度较大，功能定向进化可控性低。如果能够知晓基因组中各基因与性状改变之间的具体关系，则能够有针对性地人为改造基因组，实现微生物、动物性状改变朝向对人类有利的方向。例如在微生物发酵生产化学品领域，有针对性的改造微生物基因，能够提高微生物工程菌化学品产量。

[0024] 本发明公开了YEL013W基因和YER042W基因的应用，本领域技术人员可以借鉴本文内容，适当改进工艺参数实现。特别需要指出的是，所有类似的替换和改动对本领域技术人员来说是显而易见的，它们都被视为包括在本发明。本发明所述应用已经通过较佳实施例进行了描述，相关人员明显能在不脱离本发明内容、精神和范围内对本文所述应用进行改动或适当变更与组合，来实现和应用本发明技术。

[0025] 下面结合实施例，进一步阐述本发明。

[0026] 实施例1：构建生产类胡萝卜素的酿酒酵母菌株

[0027] 人工合成crtE，crtI和crtYB三个外源基因，构建异源类胡萝卜素合成途径crtE+crtI+crtYB，然后利用酵母同源重组机制，分别设计左端连接元件和右边连接元件，与异源类胡萝卜素合成路径一起酶切后凝胶回收，共同转化单倍体合成型synV染色体酿酒酵母。类胡萝卜素路径与Leu2营养标记一起整合到synV中的YEL063C/CAN1基因座中，获得酵母菌株yJBH000。

[0028] 实施例2：基因敲除试验验证效果

[0029] 对yJBH000中YEL013W，YEL014C(用于对照)和YER042W这三个基因分别进行单独敲除和组合敲除，获得yJBN009(敲除YEL013W基因)，yJBN010(敲除YEL014W基因，yJBN006(敲除YEL014C和YEL013W基因)，yJBN007(敲除YER042W基因)和yJBN008(敲除YEL014C、YEL013W和YER042W基因)五种试验菌株。然后按照如下方法发酵生产：

[0030] 取菌株接种到5mL YPD培养基中活化培养24小时，然后以OD600为0.1接种与40mL的YPD培养基(40g/L葡萄糖)，在30℃，250rpm摇床中发酵培养60小时。

[0031] 离心收集2mL发酵培养物，并用1mL丙酮从沉淀中提取类胡萝卜素。通过HPLC分析样品。流动相由甲醇-乙腈-二氯甲烷(9：40：1v/v)组成，流速为30mL/min。

[0032] 结果见图1，yJBN009，yJBN010，yJBN006，yJBN007和yJBN008的类胡萝卜素总产量分别是：10.97mg/L，18.94mg/L，9.63mg/L，16.05mg/L，12.73mg/L和17.56mg/L。和未敲除任何基因的yJBH000菌株相比，yJBN009，yJBN006和yJBN008的产量均有显著提升，从而证明YEL013W靶点的删除可以提升类胡萝卜素的合成，此外还可以看出YER042W的删除在高产类胡萝卜素酵母中可以提高beta胡萝卜素的比例。

[0033] 以上所述仅是本发明的优选实施方式，应当指出，对于本技术领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明原理的前提下，还可以做出若干改进和润饰，这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。