一种用于DNA原位合成的电化学芯片以及基于该芯片的DNA原位合成方法，其特征在于，所述电化学芯片包括反应区，该反应区包括电极区与涂覆于该电极区表面的高分子聚合物，所述电极区包括至少一个铂电极，所述高分子聚合物在所述电极的另一侧具有碱基序列连接端，并且此碱基序列连接端连接有保护基团；所述DNA原位合成方法包括提高所述铂电极的电位从而在电解质溶液中脱去所述保护基团、在所述碱基序列连接端连接5’端保护的碱基、在电解质溶液中脱去所述5’端保护的碱基所连接的保护基团。本发明提供的电化学芯片及基于该芯片的DNA原位合成方法可稳定、准确地进行DNA原位合成、提高DNA芯片单位面积的探针数量，也便于自动化生产，降低生产成本。