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核酸扩增有效专利 发明

技术领域

[0001] 本发明涉及对一定量的核酸进行扩增的方法和试剂盒。本发明特别地涉及等温扩增技术。经扩增的核酸可以被传感器检测到。

相关背景技术

[0002] 在进行遗传分析时,往往由于样品中存在的拷贝数太少而无法进行检测,通常需要对样品中的拷贝数进行扩增。
[0003] 例如,可以采用热循环扩增或等温扩增完成这个过程。
[0004] 等温扩增技术包括SDA、LAMP、SMAP、ICAN、SMART。通过链置换反应在恒温下进行该反应过程。通过在恒温下孵育包含样品、引物、具有链置换活性的DNA聚合酶以及底物的混合物,可以一步完成扩增。
[0005] 在环介导等温扩增(LAMP)技术中,采用4至6个被特别设计为分别识别靶基因中的6至8个特定区域的不同引物,来完成靶特异性扩增。Eiken Chemical的专利EP2045337“Process for synthesizing nucleic acid”中进一步描述了LAMP技术,在此通过引用的方式将其并入本文中。
[0006] 这种方法通常能够在15-60分钟内将核酸拷贝扩增109-1010倍。
[0007] 除了引物之外,链置换技术使用Tris和硫酸盐化合物(例如MgSO4、NH4SO4)来保持酶的功能性。
[0008] Tris为具有式(HOCH2)3CNH2的有机化合物(正式名称为三(羟甲基)氨基甲烷)。诸如LAMP之类的链置换技术使用Tris作为缓冲剂,使反应维持在最佳pH值。
[0009] Tris和硫酸盐的推荐浓度分别为大于等于20mM和12-20mM。
[0010] 核酸扩增后,核酸检验需要二级检测技术,例如分光光度法、浊度法、LFD(横向流动试纸条法)或荧光素酶法。然而,这些已知的技术存在缺陷。荧光试剂需要标记以发出紫外荧光,因而耗费昂贵。此外,诸如SYBR绿等试剂与DNA结合,使其本身具有致癌性;埃姆斯试验(Ames Test)表明其具有致突变性和细胞毒性。而且,SYBR绿是非特异性的,其可以附着在任意双链DNA上,因此增强了背景信号。浊度测量需要昂贵的仪器以提供量化。最后,LFD中所用试剂需要二次偶联,其对非特异性检测敏感。
[0011] 现有的等温扩增技术不适用于采用pH检测的体系。因此,该领域存在这样的需求:需要一种对核酸进行等温扩增并且能够利用安全廉价的设备有效地对其进行检测的试剂盒和方法。令人惊讶的是,发明人已经发现所用的试剂可以提高扩增的产量。

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