本发明提供了一种单细胞分离器，用以从细胞悬浮液中分离出单细胞。所述单细胞分离器包括探针板和细胞培养板。所述探针板上设置有至少一根探针，且所述至少一根探针的材质可为金属或可塑性材料。所述细胞培养板上设置有与所述至少一根探针相对应并用以收容细胞悬浮液的至少一个收容孔。所述至少一根探针上涂有可分离细胞的涂层，从而只需将所述至少一根探针伸入所述至少一个收容孔内，即可轻松地将单细胞分离出来。本发明的单细胞分离器不仅操作简单，同时还能够快速、准确的捕捉和分离单细胞，且对细胞本身无损伤，还有利于细胞的后续培养、扩增与检测。