本发明公开了一种复合载体负载加氢催化剂及其应用,催化剂的组成为Pd‑M@Nb2O5‑B,其中活性组分钯Pd的含量为0.2~1.5%;助剂M为银和铋中的一种或两种,且助剂M的含量与活性组分钯Pd的摩尔比为1:0.5~4之间;Nb2O5‑B为复合载体,复合载体占所述催化剂总重的97.0~99.5%;在复合载体Nb2O5‑B中,Nb2O5含量为8~15%;B为TiO2、SiO2和Al2O3中的一种或多种,TiO2、SiO2和Al2O3重量比例为1~3:5~20:100。上述催化剂具有优异耐水性,载体复杂化相比一般固体酸具有更强的酸性,产品收率更高,可提高催化剂反应生成乙酰正丙醇的稳定性。