本发明涉及一种基于改进双环小波分解的低压直流系统短路故障保护系统,包括短路故障早期检测模块和中央控制模块;当系统发生短路故障时,短路故障早期检测模块在检出短路,并将检出故障的层级支路以及短路故障电流、电压特征通过CAN总线通信发送至中央控制模块,中央控制模块确定保护分断位置的短路故障早期检测模块,并下达分断指令,短路故障早期检测模块通过RS485向对应断路器下达保护分闸信号,完成短路故障的选择性分断。本发明实现短路故障后的快速检测与选择性分断。