本发明公开了一种煤矿水害实时预警方法、系统、电子设备及存储介质。其中，煤矿水害实时预警方法包括：获取监测数据；对所述监测数据进行预处理，得到监测数据标准值；根据所述监测数据标准值和监测数据模拟值，确定第一偏差评价值；根据所述监测数据标准值和数据测量值，确定第二偏差评价值；根据所述第一偏差评价值、所述第二偏差评价值和辅助判断检测值，确定综合偏差判断值并根据所述综合偏差判断值输出预警信号，其中，所述辅助判断检测值基于所述化学有害物质数据确定。本发明解决了由于缺乏对与煤矿水害相关联的多种因素和数据源的综合分析造成的煤矿水害预警准确性不高的技术问题。