本申请公开了一种配网故障定位方法及系统，方法包括：在配网网络的所有端点各安装一台行波采集装置；根据配网网络拓扑，获取最短行波传输路径及对应的路径距离数组和边界位置数组；获取所有行波采集装置上送的故障行波电流波形，获取有效波形和有效路径；对有效波形进行小波分解，并在所有有效路径上依次进行双端测距；依次双端测距结果和路径距离数组判断初始故障区段和初始测距结果；根据初始故障区段和初始测距结果综合判定最终的故障区段和测距结果。采用本申请的方案，只需要在配网网络的所有端点安装行波采集装置，中间节点无需安装，节省装置数量，故障点在多条路径上，即使某个装置的行波采集失效，也能得出正确的测距结果，容错性较高。