本发明公开了一种适用于海上风电直流系统的故障保护方法。本发明的故障保护方法包括：当检测到故障特征出现时，采用海上风电直流系统故障启动判据、故障识别判据以及故障选极判据进行判断；当线路两端的正负极电流数据都满足故障启动判据时，直流断路器启动，向对端发送本端正负极最值信号，并接收对端发来信号；利用故障识别判据判定区内外故障，只有区内故障时才允许发出跳闸信号，利用故障选极判据选出线路的故障极；在三个判据都满足的情况下才启动保护装置。本发明采用多重检测策略，实现对电力系统的故障进行多角度、多维度的全面检测和判断，从而提高保护的可靠性和准确性。